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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004905`

染色体: Chr02 坐标: 71033826-71036449 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004905`
名称	SmilChr02G004905
描述	transcription factor bHLH47-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71033826 - 71036449 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008902`
GeneID	`131008902`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008902`
原始查询	`SmilChr02G004905`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH47-like
产物	transcription factor bHLH47-like
Arabidopsis	`AT3G47640` (PYE) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823918] identity=42.9; qcov=0.925; evalue=1.05e-34; confidence=medium
Rice	`Os03g0379300` (OsIRO3) - identity=35; qcov=0.935; evalue=1.05e-27; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008902

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791988.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791988.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791988.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791988.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71034135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:71034166`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B42,B43,B9,C26
`Chr2:71034166`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B42,B43,B9,C26
`Chr2:71034299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:71034350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B98,C87,D3
`Chr2:71034620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791988.1

214 aa

107

214

bHLH_IRO3

PF23177 bHLH_IRO3 13-94 aa

XP_057791989.1

214 aa

107

214

bHLH_IRO3

PF23177 bHLH_IRO3 13-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791988.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	13	94	1e-16	61.8	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057791989.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	13	94	1e-16	61.8	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936005.1
TCTTCATTCGATGTCTCCTACTGCGCAGGTGCCTGCCACACGCTCCATCAACTCTTCTCTCTCTCTCTTCACCAACCACAGTTCCATATTTCTGCTGCAAGAATCCCTTCATTTTCGCCAAGACAACATCTTTTGACTTCCTACAAAGTTTTATTTATGTGGGGAACTTAGATGCAACCTCATATAAATATTGCCCCCATAGTTAAGTCTAAAATGGCAATGGGCGACGTCAACGAGTGGGGATGTTTCTAGCAAGAAGA...

XM_057936006.1
TTTCTTGGCTTCAACTCTTCCTTCTTTCTGTGAGAAATTGTGATCTTGCATATTGGGATACACTTTGGGAACTTAGATGCAACCTCATATAAATATTGCCCCCATAGTTAAGTCTAAAATGGCAATGGGCGACGTCAACGAGTGGGGATGTTTCTAGCAAGAAGACAATGGGAAGGTTCCTAAGAGGATTCACAAGTCCGAGAGAGAGAGAGAAGATGAAACGCGAGAATTTGAACGAGCTTTTTTTTGCTTTAGCAAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008902
ATGGGAAGGTTCCTAAGAGGATTCACAAGTCCGAGAGAGAGAGAGAAGATGAAACGCGAGAATTTGAACGAGCTTTTTTTTGCTTTAGCAAATTCTTTAGAACTATCTGATCAGAACAACGGTAAGGCTTCTGTTTTGATTGAAGCCTCTCGAACAGTGAAAGACATGCAGGATCAGATCAAGTGTCTTAAAAAAGAGAATGCCACCTTGTTGTCTGAATCCCAATATGTAACTGTTGAGACGAACGAGCTAAAGGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791988.1
MGRFLRGFTSPREREKMKRENLNELFFALANSLELSDQNNGKASVLIEASRTVKDMQDQIKCLKKENATLLSESQYVTVETNELKDENTALEAEIGKLRTEINSKTKLQLDLNMAPPECHNQEQGSHNIDSPFVFPVMKHGPQGHIVSPHLATFCSNIQGHPVVGIEHLASQHISVVSKPHARYLTPADKWPSQVLEKHPELGKAVHQGYRYGK

XP_057791989.1
MGRFLRGFTSPREREKMKRENLNELFFALANSLELSDQNNGKASVLIEASRTVKDMQDQIKCLKKENATLLSESQYVTVETNELKDENTALEAEIGKLRTEINSKTKLQLDLNMAPPECHNQEQGSHNIDSPFVFPVMKHGPQGHIVSPHLATFCSNIQGHPVVGIEHLASQHISVVSKPHARYLTPADKWPSQVLEKHPELGKAVHQGYRYGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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