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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004926`

染色体: Chr02 坐标: 71278458-71282548 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004926`
名称	SmilChr02G004926
描述	uncharacterized SmilChr02G004926
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71278458 - 71282548 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009035`
GeneID	`131009035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009035`
原始查询	`SmilChr02G004926`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBa0091P11.7; symbol=OSJNBa0091P11.7; hit=Os03g0169800; species=rice; confidence=high
产物	OSJNBa0091P11.7; symbol=OSJNBa0091P11.7; hit=Os03g0169800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G47490` (AT3G47490) HNH endonuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823903] identity=61.8; qcov=0.99; evalue=4.97e-80; confidence=high
Rice	`Os03g0169800` (OSJNBa0091P11.7) - identity=84.2; qcov=0.689; evalue=8.17e-83; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004519 (endonuclease activity); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF01844 (HNH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057792218.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792219.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057792218.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792218.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71278711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C48,D10,D11
`Chr2:71279284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A20,A21,B12,B74,C3,C40,C49,C9
`Chr2:71279319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	99	A10,A13,A15,A16,A18,A21,A25,A3,A4,A8,A9,B100,B104,B109,B113,B115,B12,B120,B124,B127,B128,B13,B130,B132,B136,B137,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B28,B30,B33,B34,B35,B38,B39,B45,B47,B49,B5,B51,B52,B53,B58,B62,B68,B7,B70,B71,B73,B82,B83,B84,B85,B88,B89,B91,B98,C13,C17,C19,C2,C21,C25,C28,C30,C32,C35,C38,C4,C41,C42,C45,C46,C48,C49,C55,C56,C59,C6,C67,C68,C70,C71,C74,C77,C78,C82,C86,C87,D1,D10,D11,D9
`Chr2:71279349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B108,C1,C23
`Chr2:71279397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C51
`Chr2:71280283`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B15,B40,B5
`Chr2:71280283`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B15,B40,B5
`Chr2:71280307`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	211	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B118,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B57,B59,B60,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B82,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C48,C49,C51,C52,C55,C56,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C69,C70,C71,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr2:71282269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:71282303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:71282387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792218.1

212 aa

106

212

HNH

PF01844 HNH 115-148 aa

XP_057792219.1

193 aa

193

HNH

PF01844 HNH 115-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792218.1`	Pfam	`PF01844`	HNH	Family	115	148	1.2e-05	26.1	HNH endonuclease
`XP_057792219.1`	Pfam	`PF01844`	HNH	Family	115	148	2.6e-05	25.0	HNH endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936235.1
ATTCATAGAAGTAATTGATAATTTTTAATCCTCCAAATCTAACTCATAAATAAATTTCGACAAAACATCACAATTTTATCTTTAGCTGTTTTGACTTTTGAGCTCCATCTCTGATATTTCATCCTATCCCCAAAAAATGAGCCCAAAGACTCCCCAAAACCGCCGGAAAAGCAAAAAAACCACAACCTTCCCCTCTACACGGCGGGCCCCGCCCGCCAGCCCGAACCGTCGGGTCTCCCCTCCACCGTCCGCAGCGGCGC...

XM_057936236.1
AAATCTAACTCATAAATAAATTTCGACAAAACATCACAATTTTATCTTTAGCTGTTTTGACTTTTGAGCTCCATCTCTGATATTTCATCCTATCCCCAAAAAATGAGCCCAAAGACTCCCCAAAACCGCCGGAAAAGCAAAAAAACCACAACCTTCCCCTCTACACGGCGGGCCCCGCCCGCCAGCCCGAACCGTCGGGTCTCCCCTCCACCGTCCGCAGCGGCGCTCGCCGAGGGCGACCTCTTCGCCGAAGAGCTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009035
ATGAGCCCAAAGACTCCCCAAAACCGCCGGAAAAGCAAAAAAACCACAACCTTCCCCTCTACACGGCGGGCCCCGCCCGCCAGCCCGAACCGTCGGGTCTCCCCTCCACCGTCCGCAGCGGCGCTCGCCGAGGGCGACCTCTTCGCCGAAGAGCTCTCGCGATTCGAGACCCTCCAAATCTCGCCGGAGAGCCCGAACCCTCGGAGTTTCCCGCACAGTGTGAAGCAGCAATGCTGGGACAAGGCCGAGAAAATCAAGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792218.1
MSPKTPQNRRKSKKTTTFPSTRRAPPASPNRRVSPPPSAAALAEGDLFAEELSRFETLQISPESPNPRSFPHSVKQQCWDKAEKIKGRHPDRWRRDPLGNTVFRKLVGCSGCLCHDYDHIIPYSKGGKSTLENCQVLQATVNRSKGNRTEMSKSELIQKSAYCRVSGLLDFYIWLSKRVHSNIVLRNLHDTFHKMLESSLKFKMAGFVIIKS

XP_057792219.1
MSPKTPQNRRKSKKTTTFPSTRRAPPASPNRRVSPPPSAAALAEGDLFAEELSRFETLQISPESPNPRSFPHSVKQQCWDKAEKIKGRHPDRWRRDPLGNTVFRKLVGCSGCLCHDYDHIIPYSKGGKSTLENCQVLQATVNRSKGNRTEMSKSELIQKSAYCRVSGRDMDLLELSAYGNVRRGQDSGGCKIQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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