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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004937`

染色体: Chr02 坐标: 71338502-71341737 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004937`
名称	SmilChr02G004937
描述	CRS2-associated factor 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71338502 - 71341737 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008959`
GeneID	`131008959`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008959`
原始查询	`SmilChr02G004937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CRS2-associated factor 1, mitochondrial
产物	CRS2-associated factor 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G31010` (AT4G31010) RNA-binding CRS1 / YhbY (CRM) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829228] identity=63.5; qcov=0.931; evalue=5.52e-166; confidence=high
Rice	`Os08g0174900` - identity=65.8; qcov=0.823; evalue=2.37e-152; confidence=high
GO	GO:0000373 (Group II intron splicing); GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008959

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792090.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057792090.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792090.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792090.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71338691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,B41,B95,C14,C62
`Chr2:71338739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C14,C85
`Chr2:71338787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:71338792`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,A8,B102,B124,B23,C25,C6
`Chr2:71338823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr2:71338876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:71339054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr2:71339071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr2:71340016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B76,C21,C48,D2
`Chr2:71340710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr2:71341347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792090.1

423 aa

212

423

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 167-252 aa PF01985 CRS1_YhbY 287-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792090.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	167	252	2.4e-31	108.6	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057792090.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	287	370	2.4e-31	108.6	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936107.1
ATCATTGGTAACTTTAAAAGAAAAAACTAAATAAAAAAAGAAAATGGAAAGAAATTAGAAAAACAAATTCCTAAAACCCTATTCTAAAACCCTCGGCAGTTGCTCCAATGGTGTAACGAGAAAAATGGCAACCTGTCTCAGCCGTCTCCTTCGCCGCAAAACGCCGCCGGAAATAGCTGTTTTCTCCACGCGCCGCTCTCTCTCGACAAACACAGCCTCCTCCCCTTCGAAGCTCCGCTCCGAGTACAACTTCATCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008959
ATGGCAACCTGTCTCAGCCGTCTCCTTCGCCGCAAAACGCCGCCGGAAATAGCTGTTTTCTCCACGCGCCGCTCTCTCTCGACAAACACAGCCTCCTCCCCTTCGAAGCTCCGCTCCGAGTACAACTTCATCTCCCCTCCCTCTCTCCACCCGCAGCCCCCCGATAAGAGCTCCAATTTTCAACCCAAACCCGAATCCCGGACCCGGAAAAGATCCAAACCCCCTTACCGCCCGCCATCGTCACTGGATCGGCCCGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792090.1
MATCLSRLLRRKTPPEIAVFSTRRSLSTNTASSPSKLRSEYNFISPPSLHPQPPDKSSNFQPKPESRTRKRSKPPYRPPSSLDRPDPQIRSELPFDFRFSYTESNTKVRPIGLREPKYSPFGPGRLDRVWTGVCAPAVDPKVGSPGVDGELEEKRREMRERVQGVPLTNAERKAIVERFQRPKVKMQINLGRDGLTHNMLDVIHNHWKHAEAVRIKCMGVPTVDMKNICAQLEDKTFGKIINRHGGQLILYRGRHYKPSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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