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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004938`

染色体: Chr02 坐标: 71342556-71350335 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004938`
名称	SmilChr02G004938
描述	lysophospholipid acyltransferase LPEAT2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71342556 - 71350335 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008944`
GeneID	`131008944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008944`
原始查询	`SmilChr02G004938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysophospholipid acyltransferase LPEAT2
产物	lysophospholipid acyltransferase LPEAT2
Arabidopsis	`AT2G45670` (AT2G45670) calcineurin B subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819175] identity=63.1; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0712300` - identity=55.6; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0006644 (phospholipid metabolic process); GO:0008374 (GO:0008374); GO:0071618 (lysophosphatidylethanolamine acyltransferase activity)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF01553 (Acyltransferase); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057792066.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057792066.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057792066.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792066.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792066.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71342839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr2:71342936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr2:71343129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B12,C4
`Chr2:71343773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B12
`Chr2:71344376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:71344385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:71348500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792066.1

549 aa

274

549

Acyltransferase

EF-hand_7

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_6

PF01553 Acyltransferase 162-275 aa PF13499 EF-hand_7 461-515 aa PF13833 EF-hand_8 478-520 aa PF00036 EF-hand_1 493-521 aa PF13405 EF-hand_6 496-521 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792066.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	162	275	4.4e-18	66.1	Acyltransferase
`XP_057792066.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	461	515	5.6e-12	46.6	EF-hand domain pair
`XP_057792066.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	478	520	1.6e-09	38.1	EF-hand domain pair
`XP_057792066.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	493	521	3.4e-12	45.7	EF hand domain
`XP_057792066.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	496	521	1.4e-13	49.9	EF-hand domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096366.1
ACATATATTCGGAGCCTCACATGCGACTCACGTGGACTCTCTCTCTCTAACTTTTCCCTCCTTTCCTATTTGATTGCTTTATTTCCAAATTAACAAATTTAATATCCAATACAGAATCAATCTCTGGATCCCAATCCCAATTTAACCGCTCCACTGTCTTCTCTCTCTCTCTACCTTCCATCCTCAGCAATGGCGGTAGAGGACCATTCTCTCTCCACTCCCCTCCTCTCCTCCGAGCAGCAGCCCCACGTCATCGTCAC...

XM_057936083.1
TTCGGAGCCTCACATGCGACTCACGTGGACTCTCTCTCTCTAACTTTTCCCTCCTTTCCTATTTGATTGCTTTATTTCCAAATTAACAAATTTAATATCCAATACAGAATCAATCTCTGGATCCCAATCCCAATTTAACCGCTCCACTGTCTTCTCTCTCTCTCTACCTTCCATCCTCAGCAATGGCGGTAGAGGACCATTCTCTCTCCACTCCCCTCCTCTCCTCCGAGCAGCAGCCCCACGTCATCGTCACCGTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008944
ATGGCGGTAGAGGACCATTCTCTCTCCACTCCCCTCCTCTCCTCCGAGCAGCAGCCCCACGTCATCGTCACCGTCCACGACGAACCCGATCAGCCCCAACCCGAAACCAATCCGCGAGCCCTATTTCAGTCGGGAGATGAGAATCGTCACAATCCCTATGCGTTTATCGGGGCGCACGACGGATTCGAGGTGCCCGGATCCATCAGCATCGACCCGTTCCGCAATCACACGCCAAGCGTCGAGGGTTTGTACGAGTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792066.1
MAVEDHSLSTPLLSSEQQPHVIVTVHDEPDQPQPETNPRALFQSGDENRHNPYAFIGAHDGFEVPGSISIDPFRNHTPSVEGLYEWLKIVICLPIAAVRLVLFGLCLTAGYLTTRLALYGWKDRQNPMPKWRCRLMWVTRLCGRAILFSFGYHWIKRKGKPAPREIAPIVVSNHVSYIDPIFFFYELFPTIVSADTHDSMPFVGTIIRAMQVIYVDRFSKSSRKHAVNEIKRKASCNQFPRVLLFPEGTTSNGRVLISFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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