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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004956`

染色体: Chr02 坐标: 71505615-71507872 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004956`
名称	SmilChr02G004956
描述	12-oxophytodienoate reductase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71505615 - 71507872 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008975`
GeneID	`131008975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008975`
原始查询	`SmilChr02G004956`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	12-oxophytodienoate reductase 1-like
产物	12-oxophytodienoate reductase 1-like
Arabidopsis	`AT1G76680` (OPR1) 12-oxophytodienoate reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844001] identity=67.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0215600` (OsOPR5) - identity=68.5; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0010181 (FMN binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00592 (alpha-Linolenic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00724 (Oxidored_FMN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792117.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057792117.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792117.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792117.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792117.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71505782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr2:71505879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B12
`Chr2:71505921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:71505957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:71505959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:71505960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:71506038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:71506110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B25
`Chr2:71506233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B95
`Chr2:71506352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C15,D4
`Chr2:71506384`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	100	A10,A11,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A5,A6,A7,A8,B103,B109,B111,B114,B117,B120,B122,B125,B128,B13,B130,B131,B135,B137,B140,B15,B19,B20,B22,B24,B28,B3,B33,B34,B35,B36,B4,B41,B45,B46,B5,B51,B59,B60,B61,B62,B64,B65,B66,B68,B70,B71,B72,B75,B78,B8,B81,B82,B84,B90,B92,B97,C1,C15,C19,C20,C24,C26,C3,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C44,C48,C49,C50,C54,C55,C59,C6,C62,C64,C65,C66,C7,C72,C75,C8,C81,D10,D4,D6,D8
`Chr2:71506410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792117.1

369 aa

184

369

Oxidored_FMN

PF00724 Oxidored_FMN 11-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792117.1`	Pfam	`PF00724`	Oxidored_FMN	Domain	11	335	2.4e-88	297.4	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936134.1
ACTTTCTCTTGCCCCTTTTTTGACGTAAAAATGGCGCCCATTCATATTAATAATTGAGAAAGCAACATGCAAGACAATGATGTAATCGCCTACGCAATTGCCGCCACCAGCTACTATAAACCCCCCTCTGTTTTACACAGTAGTTGAACAGAGCACCAAACAAGAATTCAAAAACAGAGCAAAGCTAGAGTTATGGCAGCTGAAGATACTGATGTTATCCCCCTGCTCACCCCACACAAAATGGGGGAATTCACACTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008975
ATGGCAGCTGAAGATACTGATGTTATCCCCCTGCTCACCCCACACAAAATGGGGGAATTCACACTCTCCCACAGAATAGTATTAGCACCATTAACCAGAGACCGCTCATACAACAACGTTCCACAGCCGCATGCCGCATTGTATTACTCGCAGCGAGCAACCAAAGGCGGCCTCCTCATCACTGAAGCAACAGGTGTATCAGATACTGCTCAAGGGTACCCGGATACACCTGGAATTTGGACAAAGGAGCATGTGGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792117.1
MAAEDTDVIPLLTPHKMGEFTLSHRIVLAPLTRDRSYNNVPQPHAALYYSQRATKGGLLITEATGVSDTAQGYPDTPGIWTKEHVEAWKPIVEAVHQKGGIFFVQLWHVGRVSTYDYQPGGEAPLSSTDKGLTPGLYGVDWSPPRKLNTDEIRGIVNDFRAAARNAIEAGFDGVEIHGANGYLLEQFMKDQVNDRTDEYGGSLENRCRFALEVAAAVSDEIGSHRVGMRLSPYTDFNEAVDSDPDGLGVYMANALSKLDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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