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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004961`

染色体: Chr02 坐标: 71540679-71542055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004961`
名称	SmilChr02G004961
描述	uncharacterized SmilChr02G004961
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71540679 - 71542055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009010`
GeneID	`131009010`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009010`
原始查询	`SmilChr02G004961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835055]; symbol=AT5G49920; hit=AT5G49920; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835055]; symbol=AT5G49920; hit=AT5G49920; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G49920` (AT5G49920) Octicosapeptide/Phox/Bem1p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835055] identity=49.5; qcov=0.656; evalue=3.27e-52; confidence=high
Rice	`Os05g0427100` - identity=50.9; qcov=0.344; evalue=4.73e-30; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009010

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792177.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792177.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792177.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792177.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71541300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B93
`Chr2:71541364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:71541495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B3,B78,B91,C75
`Chr2:71541547`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr2:71541547`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr2:71541756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792177.1

308 aa

154

308

PB1

PF00564 PB1 48-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792177.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	48	122	1.7e-13	51.0	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936194.1
GTGAATAGAAGTAAATGTATAAAACGAAAATGCAGGAAAAGCACATTCTAAAAGATGCATGCATGCATCTCTCCCCCATTGATCCATCAACCAAGAGAAAATGAGCTGCTACGGCGACGGTGGTGTGTTTGCGAGGCGTACCATCTCGTGCGCTTCTGCACCCTGCTCCGCCCCTAGTTCGCCCAAGAGCAGGGTCAAATTCCTCTGCAGCCACGGCGGCAAGATCCTCCCCCGCCCCTCCGACGGCCAACTCAAGTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009010
ATGAGCTGCTACGGCGACGGTGGTGTGTTTGCGAGGCGTACCATCTCGTGCGCTTCTGCACCCTGCTCCGCCCCTAGTTCGCCCAAGAGCAGGGTCAAATTCCTCTGCAGCCACGGCGGCAAGATCCTCCCCCGCCCCTCCGACGGCCAACTCAAGTATGTCGGCGGCGAAACCCGCGTCATCTCTGTTCCCCGAGATATCTCTTTCCAAGAATTAATGAAGAGGTTGACATACATGATCGACGGCGGAATGGTGCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792177.1
MSCYGDGGVFARRTISCASAPCSAPSSPKSRVKFLCSHGGKILPRPSDGQLKYVGGETRVISVPRDISFQELMKRLTYMIDGGMVLKYQLATEDLDALVTVKSEEDLVHMFDEMEHYQMMGLPRMRTFLFPIHNTVMDEQLPLDQRYIFSINGIITPSPSKKPHHLAVGSLASSTCTSPKSPDSYAAEANFSTAFANGNMHRIQSSPSISNLLNIAQQNNSNSHYSPHHQLPPQYYHTHSGYRSPNPPFRSGPRFQPDYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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