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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004963`

染色体: Chr02 坐标: 71547117-71552768 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004963`
名称	SmilChr02G004963
描述	coatomer subunit delta-2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71547117 - 71552768 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008946`
GeneID	`131008946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008946`
原始查询	`SmilChr02G004963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit delta-2
产物	coatomer subunit delta-2
Arabidopsis	`AT5G05010` (AT5G05010) clathrin adaptor complexes medium subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830383] identity=69.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0311000` - identity=71.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0030126 (COPI vesicle coat); GO:0051645 (Golgi localization)
KEGG	-
Pfam	PF00928 (Adap_comp_sub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792067.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057792067.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057792067.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057792067.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71547937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:71547972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C47
`Chr2:71549239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B28,C60,C62,C70
`Chr2:71549485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:71549910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:71549938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792067.1

527 aa

N

1

264

527

Adap_comp_sub

C

PF00928 Adap_comp_sub 284-526 aa

XP_057792068.1

527 aa

N

1

264

527

Adap_comp_sub

C

PF00928 Adap_comp_sub 284-526 aa

XP_057792069.1

527 aa

N

1

264

527

Adap_comp_sub

C

PF00928 Adap_comp_sub 284-526 aa

XP_057792070.1

527 aa

N

1

264

527

Adap_comp_sub

C

PF00928 Adap_comp_sub 284-526 aa

XP_057792072.1

527 aa

N

1

264

527

Adap_comp_sub

C

PF00928 Adap_comp_sub 284-526 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792067.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	284	526	4.4e-37	128.5	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057792068.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	284	526	4.4e-37	128.5	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057792069.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	284	526	4.4e-37	128.5	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057792070.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	284	526	4.4e-37	128.5	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057792072.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	284	526	4.4e-37	128.5	Adaptor complexes medium subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936084.1
CATTTGCAAAATGAGGATATTTCAAGGGTGACAGTGCAAACCAGCCTAACCATATACAACCCCCATTTCTTCGCGATTAATTTACAATTTCATCGCACTCTGCAGTCTACTCGCTTGATCTGGATCTTGGTGAATTTGAAGGTGTTGTTGGGGCTTTTCTCTTGTTAGTCTCACGTTTAATTGATTATTAGTGTCCCGTGGGAGAATTAAGAAAACAAGATGGTTGTACTTGCGGCTTCCATCATAAGTAAATCGGGCAA...

XM_057936087.1
AAGGGTGACAGTGCAAACCAGCCTAACCATATACAACCCCCATTTCTTCGCGATTAATTTACAATTTCATCGCACTCTGCAGTCTACTCGCTTGATCTGGATCTTGGTGAATTTGAAGCCACGCTTGATTTTCTAAATCTCAGGTTTCATGTATCTGTACGTTTTACGATTTTGAAACCTAGATCGTTGCATCGGGCGGGATCTGGATAATGTGATTGTGTGTTGTTGGGGCTTTTCTCTTGTTAGTCTCACGTTTAATT...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131008946
ATGGTTGTACTTGCGGCTTCCATCATAAGTAAATCGGGCAAAGCACTTGTCTCGAGGCAGTTTGTTGATATGTCTCGTATACGAATTGAGGGGTACCTTGCAGCTTTCCCCAAATTGGTGGGAACAGGGAAGCAACATACTTATGTTGAGACTGAGAATGTCCGTTATGTTTATCAGCCAATAGAGACCCTCTATTTGCTTCTTGTTACAAATAAGCAGAGCAACATTCTCGAGGATTTGGAGACATTGAGGCTACTTTC...

LOC131008946
ATGGTTGTACTTGCGGCTTCCATCATAAGTAAATCGGGCAAAGCACTTGTCTCGAGGCAGTTTGTTGATATGTCTCGTATACGAATTGAGGGGTACCTTGCAGCTTTCCCCAAATTGGTGGGAACAGGGAAGCAACATACTTATGTTGAGACTGAGAATGTCCGTTATGTTTATCAGCCAATAGAGACCCTCTATTTGCTTCTTGTTACAAATAAGCAGAGCAACATTCTCGAGGATTTGGAGACATTGAGGCTACTTTC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057792067.1
MVVLAASIISKSGKALVSRQFVDMSRIRIEGYLAAFPKLVGTGKQHTYVETENVRYVYQPIETLYLLLVTNKQSNILEDLETLRLLSKLVPEYSYSLDEEGIGKTAFEILFAFDEVISLGHKENVTVAQVKQYCEMESHEEKLHKLVLQSKINETKDVMKRKASEIDKSKIEKNRGDKGGFMSLQSMGSGRIDTGFGSDTSISSSGGGFGGGSSFGLSTEVDSFSKPKGRPASSASAPPKGFGMQLGKTQRTNQFLESLK...

XP_057792068.1
MVVLAASIISKSGKALVSRQFVDMSRIRIEGYLAAFPKLVGTGKQHTYVETENVRYVYQPIETLYLLLVTNKQSNILEDLETLRLLSKLVPEYSYSLDEEGIGKTAFEILFAFDEVISLGHKENVTVAQVKQYCEMESHEEKLHKLVLQSKINETKDVMKRKASEIDKSKIEKNRGDKGGFMSLQSMGSGRIDTGFGSDTSISSSGGGFGGGSSFGLSTEVDSFSKPKGRPASSASAPPKGFGMQLGKTQRTNQFLESLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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