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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004964`

染色体: Chr02 坐标: 71556097-71562272 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004964`
名称	SmilChr02G004964
描述	MACPF domain-containing protein At4g24290
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71556097 - 71562272 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008934`
GeneID	`131008934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008934`
原始查询	`SmilChr02G004964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MACPF domain-containing protein At4g24290
产物	MACPF domain-containing protein At4g24290
Arabidopsis	`AT4G24290` (AT4G24290) MAC/Perforin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828532] identity=74.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0166100` (P0039H02.131) - identity=71.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009626 (plant-type hypersensitive response); GO:2000031 (regulation of salicylic acid mediated signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF01823 (MACPF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792038.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792038.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792038.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792038.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71557051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C46,C58,C85
`Chr2:71557520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:71558261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:71558363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B135,C57
`Chr2:71559473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B93
`Chr2:71559716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:71560121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B10,B112,B2,C63
`Chr2:71560163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:71561155`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B94
`Chr2:71561155`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B94
`Chr2:71561251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B93
`Chr2:71561332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792038.1

598 aa

299

598

MACPF

PF01823 MACPF 18-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792038.1`	Pfam	`PF01823`	MACPF	Domain	18	320	9.7e-39	134.3	MAC/Perforin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936055.1
TAACGATTTGAAATGAGTTCATGTCCACGACTCCACGGTCCACCCCAAATTTGGATAATCGTACCCTTGTTTATTTTGAATTAACTTGAATACCATTTTTTTATCTTTCTTTCATCTCCACTAAAAGAAGCTCCCGGTTTTCCTCTAGATCTGAGTCAGTTCAGCCTCACTGCGATAATCTAGGGTTTGAAGTTTTGCAGCACCAGTTCCCGAGGAACTCAAGCTAGCTAGGTTTTGAGTCCCCAATTTTAGTGAAATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008934
ATGGCGCTTAAGCTTGCGGCTGCAGAAGCAGCTAAGGTGGCTATTCTGTCGATTGGTCGTGGATATGATATCTCCTTGGATCTTAGACTAAAGTATTGTAAGGGCGATTCGCGTATGATTGAGATTAATGAGGATCAGGGTCGGGAGATTATTCTTCCAGGTGGAACCTCAGTTGCAGGTGTTTCGAAATCAATCAAATGCGATAAAGGAGAGCGGACACGGTTTCGTTCTGACGTTCTGACTTTCCAGCAGATGTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792038.1
MALKLAAAEAAKVAILSIGRGYDISLDLRLKYCKGDSRMIEINEDQGREIILPGGTSVAGVSKSIKCDKGERTRFRSDVLTFQQMSEQLNQELSLTGKIPSGLFNAMFEFSGCWQKDAAYTKTLAFDGMFITLYTVALEKSQMVLKDHVKKEVPASWEPAALARFISKFGTHIIVGVKMGGKDVIYMKQQHSSSLQPADVQKRLKVMADKRFLDANGQNELGSEQVYQIEKFEMKETRLRFADTVTSSSYSHKDDIVSIC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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