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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004980`

染色体: Chr02 坐标: 71690938-71693684 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004980`
名称	SmilChr02G004980
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71690938 - 71693684 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009045`
GeneID	`131009045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009045`
原始查询	`SmilChr02G004980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 3
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 3
Arabidopsis	`AT5G26749` (AT5G26749) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922524] identity=45.5; qcov=1; evalue=3.62e-40; confidence=medium
Rice	`Os01g0252200` (OsC3H3) - identity=51.5; qcov=1.08; evalue=2.05e-47; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH); PF06220 (zf-U1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792233.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057792233.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792233.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057792233.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71690991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B1,C5,C8
`Chr2:71691006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B67,D4
`Chr2:71691236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B130,B55,B89,C23
`Chr2:71693224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,C5,C79,C8,D8
`Chr2:71693348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C26,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792233.1

154 aa

154

zf-U1

zf-CCCH

PF06220 zf-U1 5-38 aa PF00642 zf-CCCH 63-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792233.1`	Pfam	`PF06220`	zf-U1	Domain	5	38	1.9e-10	41.1	U1 zinc finger
`XP_057792233.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	63	85	5e-06	27.0	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936250.1
AAGCTTTTAAAAACCAATAGATACAAATATTGTGGGAGATTAGGAAAAATGCCGCTGGGGAAATACTACTGCGATTATTGCGATAAACAATTCCAGGACACTCCGCCGTCACGGCGGCGCCACCTCAACGGCGTAGCTCACCAGAGGGCCAAAGCTCTCTGGTACGACGCCCTTCGCTCCTCCTCGCAATTGGCTCCGGATCAGGTTGACGACTTCCAGTCCGTTGGCAAAGGCGTCTGCCATCGATTTGTCCGTACGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009045
ATGCCGCTGGGGAAATACTACTGCGATTATTGCGATAAACAATTCCAGGACACTCCGCCGTCACGGCGGCGCCACCTCAACGGCGTAGCTCACCAGAGGGCCAAAGCTCTCTGGTACGACGCCCTTCGCTCCTCCTCGCAATTGGCTCCGGATCAGGTTGACGACTTCCAGTCCGTTGGCAAAGGCGTCTGCCATCGATTTGTCCGTACGGGTTCATGCCAATATGGACATTCATGCAAGTATTATCACCCCAAGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792233.1
MPLGKYYCDYCDKQFQDTPPSRRRHLNGVAHQRAKALWYDALRSSSQLAPDQVDDFQSVGKGVCHRFVRTGSCQYGHSCKYYHPKKNLPNMNAQRMEGTTAQSGGIPGSRLNGGATLPALLFGNQMGMSLGNLPPSLLPPPEGGYPPLPFVDWG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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