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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004989`

染色体: Chr02 坐标: 71756251-71760774 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004989`
名称	SmilChr02G004989
描述	galactinol synthase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71756251 - 71760774 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008988`
GeneID	`131008988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008988`
原始查询	`SmilChr02G004989`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	galactinol synthase 2-like
产物	galactinol synthase 2-like
Arabidopsis	`AT2G47180` (GolS1) galactinol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819331] identity=63.3; qcov=0.948; evalue=4.03e-131; confidence=high
Rice	`Os03g0316200` (OsGolS1) - identity=62.1; qcov=0.925; evalue=1.3e-127; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792134.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792134.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057792133.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057792134.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792134.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71756649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B78,C60,C9
`Chr2:71756679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:71756728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B55,C23
`Chr2:71756961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:71757503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B44,B64,D11
`Chr2:71757598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:71760432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792133.1

358 aa

179

358

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 86-318 aa

XP_057792134.1

305 aa

152

305

Glyco_transf_8

PF01501 Glyco_transf_8 32-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792133.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	86	318	1.3e-35	124.0	Glycosyl transferase family 8
`XP_057792134.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	32	265	3.8e-36	125.7	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936150.1
AAGACAATGTTTTCTGAAGCAATCTGAATTAAGATTTCAAAATACTCTACTGAAATTGGTAAATTTTCTCGGTTTTCTGACATACAAAATATGGTATACCTTACCCCTATCAAATTGATGCCGCCGGTGAATTTCATCTCCGGCGATTGGAACTATTCAATGCTCAGGAAGAAAAGAAAACTCTGCTTATTTCGAGAGATTTTAGGTATTCCGATTTATAGGTCGCGCTGTATGAGGACAAGCTATCGTACTCCATCATC...

XM_057936151.1
TTCAGGTATTCCGATTTATAGGTCGCGCTGTATGAGGACAAGCTATCGTACTCCATCATCTATGTTCCTCGATTTTCTGAATTCATCTGTAATGCTTCCTTAGCTCTTGTGGTAATTCTTTTCAACGTTCTACCAGTAATATCTTTTACATTTTTAATGTTTTAGGTGACCAGCTTCTGTATTTGTAATATCAGTTGTTCCTAACCTTCTAAACTTACTGCTATGTAAAACTCCATTTTCTTATCTGTTTAACATGAGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008988
ATGGTATACCTTACCCCTATCAAATTGATGCCGCCGGTGAATTTCATCTCCGGCGATTGGAACTATTCAATGCTCAGGAAGAAAAGAAAACTCTGCTTATTTCGAGAGATTTTAGGTATTCCGATTTATAGGTCGCGCTGTATGAGGACAAGCTATCGTACTCCATCATCTATGTATCGTAATGACTCCTACCCCAACTCATATGATGCAACTATAAAAGCAGTACCCAGAGGAGAACATGCACCATTGAAGCTATACAT...

LOC131008988
ATGGATCATGAACTTATCATTTCAGTAACCAAAACTACAGCTGAGCTAGCTGATGAGATTATAGATAGCAGTCCTCGTAGTTATGCATATGTTACTTTCTTGGCAGGTGATGGTGATTATGTGAAAGGTGTTGTTTGTCTGGCGAAGGGATTAAGGAGGGTGCAAGCAGCTTATCCACTAGTAGTTGCGGTTTTACCTGACGTGCCAGAGGAGCATCGCAACATGCTCTTGAACCAGGGATGTCTCCTTCGTGAGATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792133.1
MVYLTPIKLMPPVNFISGDWNYSMLRKKRKLCLFREILGIPIYRSRCMRTSYRTPSSMYRNDSYPNSYDATIKAVPRGEHAPLKLYIQSDGDYVKGVVCLAKGLRRVQAAYPLVVAVLPDVPEEHRNMLLNQGCLLREIDPVLPPVSNKESSFAREYFAVNYCKLRLWKFVEYRKMIYMDADIQVLGNIDNLFDLPSGCFYAVMDCLCEMDGHTCPEVVQWPQELGERPSFYLNCGMFLFEPCLDTYASLLSTLDVTPPT...

XP_057792134.1
MDHELIISVTKTTAELADEIIDSSPRSYAYVTFLAGDGDYVKGVVCLAKGLRRVQAAYPLVVAVLPDVPEEHRNMLLNQGCLLREIDPVLPPVSNKESSFAREYFAVNYCKLRLWKFVEYRKMIYMDADIQVLGNIDNLFDLPSGCFYAVMDCLCEMDGHTCPEVVQWPQELGERPSFYLNCGMFLFEPCLDTYASLLSTLDVTPPTPFAEQDFLNLFFKDNAKPIHPVYNLLVAMLWRHPEYVELDIVKVVHFCVAGSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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