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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004992`

染色体: Chr02 坐标: 71778087-71779277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004992`
名称	SmilChr02G004992
描述	probable carboxylesterase 18
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71778087 - 71779277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008987`
GeneID	`131008987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008987`
原始查询	`SmilChr02G004992`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 18
产物	probable carboxylesterase 18
Arabidopsis	`AT5G23530` (CXE18) carboxyesterase 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832418] identity=48; qcov=0.911; evalue=3.43e-106; confidence=high
Rice	`Os07g0643400` (OJ1003_C06.126) - identity=49.5; qcov=0.928; evalue=8.77e-97; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792132.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792132.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057792132.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792132.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71778157`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,B136
`Chr2:71778157`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B136
`Chr2:71778160`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B1,B129,B64,B97,C22,C23,C75
`Chr2:71778175`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A1,A13,A9,B135,B53,B57,B60,B79,C27,C61,D2
`Chr2:71778189`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	42	A10,A22,A7,A8,B10,B110,B112,B118,B137,B138,B140,B19,B26,B27,B29,B40,B46,B52,B87,B93,C16,C2,C26,C30,C32,C37,C43,C48,C5,C51,C52,C60,C63,C64,C65,C66,C68,C80,C85,D1,D4,D7
`Chr2:71778194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B136
`Chr2:71778203`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A20,B110,B112,B12,B123,B136,B22,B28,B41,B51,B8,B90,B92,B97,C21,C25,C28,C34,C6,C73,C81
`Chr2:71778205`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A20,B110,B112,B12,B123,B136,B22,B28,B41,B51,B8,B90,B92,B97,C21,C25,C28,C34,C6,C73,C81
`Chr2:71778230`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A20,B104,B110,B12,B123,B136,B22,B41,B51,B90,B92,B97,C21,C25,C28,C34,C6,C73
`Chr2:71778337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C77
`Chr2:71778385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr2:71778406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792132.1

359 aa

180

359

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF20434 BD-FAE 108-218 aa PF07859 Abhydrolase_3 122-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792132.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	108	218	4.6e-10	40.1	BD-FAE
`XP_057792132.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	122	337	4.2e-59	200.6	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936149.1
ATACTATACTAATTTAGTTGTTTAGGTAGACCTGCCCATTGAAAAATAATAATTAAAATTAATTTATGATATTACTTTCTTCAACTCCTCCCCTCCTTTCTTTCACACACACACACTGCAATATTAATTTGCAGAGCTGCAACCGAGAAATCATCAAACCACCAAACATGGCCAATCACAGCGCAAAACCTACCTTCCCATTGATGATGCGGCTCAAATTCTTCATCGGTTCATTCATGTTAAAGCGCGTCATGCGCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008987
ATGATATTACTTTCTTCAACTCCTCCCCTCCTTTCTTTCACACACACACACTGCAATATTAATTTGCAGAGCTGCAACCGAGAAATCATCAAACCACCAAACATGGCCAATCACAGCGCAAAACCTACCTTCCCATTGATGATGCGGCTCAAATTCTTCATCGGTTCATTCATGTTAAAGCGCGTCATGCGCTCCGACGGAACCATCAACCGCCGCCTCCTTAGCCTCCTCGACCCCAAAATCCCCGCCGCCCCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792132.1
MILLSSTPPLLSFTHTHCNINLQSCNREIIKPPNMANHSAKPTFPLMMRLKFFIGSFMLKRVMRSDGTINRRLLSLLDPKIPAAPAASPVSSSDVSVDPSRDLWFRLFVPSSSTAQKLPLITYFHGGGFSCFSPHSKSCHELCRALAARIPAVVASVNYRLAPEHKYPCQYDDGFDALKFINDANRDVLPPCADLRRCFLAGDSAGGNIAHHVAVRAGLDGIELAGIVAVQPFFGGEERTEAEVRLAKGPVLTAEGADAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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