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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004993`

染色体: Chr02 坐标: 71782204-71784567 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004993`
名称	SmilChr02G004993
描述	chloroplast stem-loop binding protein of 41 kDa b, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71782204 - 71784567 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008971`
GeneID	`131008971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008971`
原始查询	`SmilChr02G004993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplast stem-loop binding protein of 41 kDa b, chloroplastic
产物	chloroplast stem-loop binding protein of 41 kDa b%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G09340` (CRB) chloroplast RNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837455] identity=83.6; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0420200` (CSP41b) - identity=83; qcov=0.945; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0006364 (rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF01370 (Epimerase); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792113.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057792113.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792113.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792113.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71782502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:71782655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B75,B98
`Chr2:71782909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B2,C36
`Chr2:71783041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,C14,C47,C70,C8
`Chr2:71783062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B7,B70
`Chr2:71783445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B136,B139,C36
`Chr2:71783756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B17,B42,B90,B92
`Chr2:71783919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:71783986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C60
`Chr2:71784013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B137,B79
`Chr2:71784014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792113.1

379 aa

190

379

Epimerase

NAD_binding_10

PF01370 Epimerase 56-273 aa PF13460 NAD_binding_10 60-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792113.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	56	273	1.5e-16	61.2	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057792113.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	60	212	1.7e-07	32.0	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936130.1
ATCCCTATTGTAAGAATCACACACTCTCAAATAATAACCCCATAAAATGTTTATGACCCATTTCAGTTTTTCTCCCAACAAACTAACTGATCACGGTGGTGGTTGCGGCTGCTTATATTCATTATGGCAAGTCTGGTGGTGGTGCAGCACAGACAACCCTCTTCCGCCGTCCTCTCATCCTCACTCTCCGACTTCAACGGCGCCAGACTCACTTCCTCACTCCAGTTGAAGAGGAAAGTATGGCAGCCGAAAGGGGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008971
ATGGCAAGTCTGGTGGTGGTGCAGCACAGACAACCCTCTTCCGCCGTCCTCTCATCCTCACTCTCCGACTTCAACGGCGCCAGACTCACTTCCTCACTCCAGTTGAAGAGGAAAGTATGGCAGCCGAAAGGGGCATTACGCGTTAGTGCATCGAGTGCCAAGAAGATCCTTATAATGGGAGGCACTCGATTCATTGGCATATTCTTGTCTAGACTCCTTGTCAAAGATGGCCATCAGGTCACTCTTTTCACTAGAGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792113.1
MASLVVVQHRQPSSAVLSSSLSDFNGARLTSSLQLKRKVWQPKGALRVSASSAKKILIMGGTRFIGIFLSRLLVKDGHQVTLFTRGKAPIAQQLPGEPDAEFADFSSKILHLKGDRKDFDFVKTSLAAEGFDVVYDINGREAVEVEPILDALPNLEQFIYCSSAGVYLKTDYPPHYEVDAVDPKSRHKGKLETESLLASRDVNWTSIRPVYIYGPLNYNPVEEWFFHRLKAGRPIPVPNSGIQITQLGHVKDLATAFIKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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