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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004995`

染色体: Chr02 坐标: 71790822-71795274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004995`
名称	SmilChr02G004995
描述	AP-3 complex subunit mu
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71790822 - 71795274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008964`
GeneID	`131008964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008964`
原始查询	`SmilChr02G004995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-3 complex subunit mu
产物	AP-3 complex subunit mu
Arabidopsis	`AT1G56590` (ZIP4) Clathrin adaptor complexes medium subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842113] identity=77.1; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0383100` - identity=72.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030131 (clathrin adaptor complex); GO:0031410 (cytoplasmic vesicle)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00928 (Adap_comp_sub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792097.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057792098.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057792097.1`
4	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057792097.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057792098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71791909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:71792847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:71792893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:71793084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:71793192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:71793914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr2:71794256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B44
`Chr2:71794315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:71794317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B112,C30,C63
`Chr2:71794679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr2:71794729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C51,C74,D4
`Chr2:71794775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792097.1

415 aa

208

415

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 167-414 aa

XP_057792098.1

341 aa

170

341

Adap_comp_sub

PF00928 Adap_comp_sub 93-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792097.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	167	414	1.4e-68	231.7	Adaptor complexes medium subunit family
`XP_057792098.1`	Pfam	`PF00928`	Adap_comp_sub	Family	93	340	8.1e-69	232.6	Adaptor complexes medium subunit family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936114.1
TTCGACGTTGATCCGATGATTGAAACATTAATCAAATTTTCCTTTTCAGAAACAGAAATGAGTTGGCAAAATTTCTATTACAAATAGATTAAAGTATTCCTTTTCTTTTTGGAGGGGTTCTTTCAATTTGTTTCACTAAATACTACTCACGTGTAAAAGAGAAAATAGTTGTATTATTGTTTGAGGATTTGAGCCCAGTTTGAGAATCGGAATAGAGTTTACAACGGATTGGATCAGAGACTTAAGTGCTCTACAAATTT...

XM_057936115.1
AATCGAGAAAAACATGTTGCAGTGTATATTTCTTCTATCAGATTCCGGGGAAGTGTTGCTTGAGAAACAGCTTACTGGTCACCGGGTTGACCGCGCCATATGTGATTGGTTCTGGGACCAAATACTTACTCAAGCTTGTACCTGTTATTGCTTCACCCACCCACTACCTATTTCAAGTGGTTCGTGAGGGGATCACCTTCTTGGCATGCACCCAAGTTGAGATGCCACCTTTAATGGCAATTGAGTTTCTTTGCAGGGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008964
ATGTTGCAGTGTATATTTCTTCTATCAGATTCCGGGGAAGTGTTGCTTGAGAAACAGCTTACTGGTCACCGGGTTGACCGCGCCATATGTGATTGGTTCTGGGACCAAATACTTACTCAAGGTGATTCTTTGAAGCTTGTACCTGTTATTGCTTCACCCACCCACTACCTATTTCAAGTGGTTCGTGAGGGGATCACCTTCTTGGCATGCACCCAAGTTGAGATGCCACCTTTAATGGCAATTGAGTTTCTTTGCAGGGT...

LOC131008964
ATGCCACCTTTAATGGCAATTGAGTTTCTTTGCAGGGTTGCTGATGTTCTTTCGAATTATTTGGATGGCTTGAATGAAGATCTGATTAAGGATAACTTCGTTATTGTTTATGAGCTGCTAGATGAGATGATAGACAATGGCTTTCCTCTAACAACAGAACCCAATATCCTGAGGGAAATGATAGCTCCTCCAAACATTGTTAGTAAGGTTCTGAGTGTTGTCACTGGTAACACGTCCAATGTGAGCAATACACTTCCAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792097.1
MLQCIFLLSDSGEVLLEKQLTGHRVDRAICDWFWDQILTQGDSLKLVPVIASPTHYLFQVVREGITFLACTQVEMPPLMAIEFLCRVADVLSNYLDGLNEDLIKDNFVIVYELLDEMIDNGFPLTTEPNILREMIAPPNIVSKVLSVVTGNTSNVSNTLPGATASCVPWRKTDLKHATNEVYVDLVEEMDATINRDGNLVKCEIYGEVQVNSNLSGLPDLTLSFANPSIFNDVRFHPCVRLRPWESNQILSFVPPDGQFK...

XP_057792098.1
MPPLMAIEFLCRVADVLSNYLDGLNEDLIKDNFVIVYELLDEMIDNGFPLTTEPNILREMIAPPNIVSKVLSVVTGNTSNVSNTLPGATASCVPWRKTDLKHATNEVYVDLVEEMDATINRDGNLVKCEIYGEVQVNSNLSGLPDLTLSFANPSIFNDVRFHPCVRLRPWESNQILSFVPPDGQFKLMSYRVKKLKSTPIYVKPQFTSDSGTCRISVLVGIRNDPGKSIDNMTVQFRLPPCITSSDLSSNHGAVNVLADK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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