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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005018`

染色体: Chr02 坐标: 71955985-71957514 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005018`
名称	SmilChr02G005018
描述	nicotianamine synthase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71955985 - 71957514 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009005`
GeneID	`131009005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009005`
原始查询	`SmilChr02G005018`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nicotianamine synthase-like
产物	nicotianamine synthase-like
Arabidopsis	`AT5G04950` (NAS1) nicotianamine synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830377] identity=53.7; qcov=1.02; evalue=1.51e-119; confidence=high
Rice	`Os07g0689600` (OsNAS3) - identity=54.2; qcov=0.937; evalue=5.02e-99; confidence=high
GO	GO:0030410 (nicotianamine synthase activity); GO:0030418 (nicotianamine biosynthetic process)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00999 (Biosynthesis of various plant secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03059 (NAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792170.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792170.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057792170.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792170.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71956440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:71956648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:71956649`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr2:71956649`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr2:71956718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B67,C37
`Chr2:71956777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B104,B140,C45,D1
`Chr2:71956854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B77,C38,D7
`Chr2:71956908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:71956912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:71957013`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B45
`Chr2:71957013`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B45
`Chr2:71957019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C39,C79,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792170.1

319 aa

160

319

NAS

PF03059 NAS 6-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792170.1`	Pfam	`PF03059`	NAS	Family	6	273	4.3e-115	384.5	Nicotianamine synthase protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936187.1
CCCACCCCAATGAGATGGCCCCACAATTGCCATTAAATAGCCCCCTTGGAGGCATGAAATCCCACAAACACAAACACAAACACAGTAGTAAAGAGGATCAGTGAGACTAGCTAGTTTGGAAAATTTGAATTGAAAAGAAAGATGGTTTGCGTGAGAGAGCCTCTGGTTCAGAAAGTGCAGCAGCTATACGATCGCATCTCGAAGCTTGAGGATCTCCGCCCCTCGAAAGAGGTGGACGCCGTCTTCACCGAGCTGGTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009005
ATGGTTTGCGTGAGAGAGCCTCTGGTTCAGAAAGTGCAGCAGCTATACGATCGCATCTCGAAGCTTGAGGATCTCCGCCCCTCGAAAGAGGTGGACGCCGTCTTCACCGAGCTGGTCCACGTCTGCATTCCCCCTCACCCCATCGACCCGGCCAAGCTCTGCCCCGAGATCCAGGAGATGCGCGCCAAGCTCATCTCCCTCTGCGGCCGCGCCGAGGGCCTCATGGAGCAGCACTTCTCCACCCTCCTCGCCGCCTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792170.1
MVCVREPLVQKVQQLYDRISKLEDLRPSKEVDAVFTELVHVCIPPHPIDPAKLCPEIQEMRAKLISLCGRAEGLMEQHFSTLLAAFDRPLDHLPLFPYHSNYLKLARLESDLLAPHCPHPPARVAFVGSGPLPLTSIVLAAHHLRSTVFHNFDIDASANAMAAKLVAPHPDIAARMGFYTGDIMHVPGGVLRQYDVVFLAALVGMDVEEKMHVVEHLAANMAPGAILMLRSAHGARAFLYPVVDPRLLRGFQLLSLYHPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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