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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005020`

染色体: Chr02 坐标: 71966490-71968279 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005020`
名称	SmilChr02G005020
描述	universal stress protein A-like protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	71966490 - 71968279 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009042`
GeneID	`131009042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009042`
原始查询	`SmilChr02G005020`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	universal stress protein A-like protein
产物	universal stress protein A-like protein
Arabidopsis	`AT3G62550` (AT3G62550) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825429] identity=46.1; qcov=0.963; evalue=4.24e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0303800` - identity=57.8; qcov=0.963; evalue=1.1e-62; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792230.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792229.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792229.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792229.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792229.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:71967087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B71,C62
`Chr2:71967132`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	B24,B32,B34,B38,B39,B58,B91,C13,C30,C59,C70,C81
`Chr2:71967141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B12,C70
`Chr2:71967197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:71967738`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C72
`Chr2:71967738`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C72
`Chr2:71967841`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A8,B102,B103,B120,B125,B138,B18,B21,B4,B54,B55,B71,B9,B99,C14,C19,C22,C4,C64,C66,C73,C79,C86
`Chr2:71967851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	88	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A2,A21,A22,A23,A3,A7,A9,B101,B107,B11,B114,B117,B118,B121,B122,B127,B132,B133,B135,B14,B25,B41,B49,B50,B51,B53,B54,B57,B59,B6,B60,B62,B63,B66,B68,B69,B70,B71,B72,B78,B79,B82,B83,B88,B89,B98,C1,C11,C15,C18,C24,C26,C27,C3,C33,C35,C36,C40,C42,C44,C46,C47,C49,C50,C52,C53,C56,C57,C61,C62,C63,C67,C69,C71,C76,C80,C82,D2,D5,D6
`Chr2:71967875`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A13,A2,A21,A3,B132,B135,B51,B68,B69,B82,C11,C18,C3,C33,C69,D5
`Chr2:71968046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A22,B118,B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792229.1

169 aa

169

Usp

PF00582 Usp 6-136 aa

XP_057792230.1

160 aa

160

Usp

PF00582 Usp 6-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792229.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	6	136	4e-18	67.0	Universal stress protein family
`XP_057792230.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	6	156	4e-29	102.7	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936247.1
ACATTATTAATGAGACGGATTGAGTATTTTATATTGAGATTGTAATGAGTAATATAGCATTATGAATACAATAAATTTTTTTCATCCTTTGTTTTTGGGAAACCATGGTCTACTCTAATTCTAAAAAGCTAATACTCTCCTCGTCCCACTTAAATTAGCACTTTTGAGTTGGACACGGAGATTAAGAATAAAAGATTAAGAGTGTAAAATAGGTAGGATTCACTTATTTAATGTGTGTAGAGAAAGTATGAGATCACATA...

XM_057936246.1
ACACACCACATTTGGTAACTTGGTCAAGAAAAGGAGAGTTTCCACATTAAAAAGTAGTAGTGATATAAATAGAATGGGAGAAAAGGGGAAGAAGATATTAGTTGGTGTTGATGAAGGCGAGGAGAGTGGGTACGCGCTCTCATGGTGCCTCCAAAATTTGCTATCTCACTCTAATTCCGAAGATACCCTTATCCTACTCTTCGCCAAGACGCCCCTGCCTATCTACTCAGCCATCGACTCAACAGGGTACCTATTTTCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009042
ATGGGAGAAAAGGGGAAGAAGATATTAGTTGGTGTTGATGAAGGCGAGGAGAGTGGGTACGCGCTCTCATGGTGCCTCCAAAATTTGCTATCTCACTCTAATTCCGAAGATACCCTTATCCTACTCTTCGCCAAGACGCCCCTGCCTATCTACTCAGCCATCGACTCAACAGGGTACCTATTTTCTCAAAATATAGTGGCCACGATGGACACGTACGCCAATCAAGTGGCTGACGCCGTTATGCAGAAGGCTTCTACACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792229.1
MGEKGKKILVGVDEGEESGYALSWCLQNLLSHSNSEDTLILLFAKTPLPIYSAIDSTGYLFSQNIVATMDTYANQVADAVMQKASTLCSTFNHQAKVETMVEHGDPRDVICQVAERLKVDLLVLGSHGYGLIKRLIYFNFWINYLCILITIIFLRYTKQCELLFVNSEL

XP_057792230.1
MGEKGKKILVGVDEGEESGYALSWCLQNLLSHSNSEDTLILLFAKTPLPIYSAIDSTGYLFSQNIVATMDTYANQVADAVMQKASTLCSTFNHQAKVETMVEHGDPRDVICQVAERLKVDLLVLGSHGYGLIKRTFLGSVSQHCAQQVKCPVLIVKKPTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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