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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005030`

染色体: Chr02 坐标: 72028583-72031583 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005030`
名称	SmilChr02G005030
描述	protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72028583 - 72031583 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009028`
GeneID	`131009028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009028`
原始查询	`SmilChr02G005030`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 3-like
产物	protein DEHYDRATION-INDUCED 19 homolog 3-like
Arabidopsis	`AT3G05700` (AT3G05700) Drought-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819739] identity=58.3; qcov=1.01; evalue=2.45e-90; confidence=high
Rice	`Os05g0358000` (OsDi19-2) - identity=50; qcov=0.959; evalue=2.19e-57; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05605 (zf-Di19); PF14571 (Di19_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792204.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792204.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792204.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792204.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72028868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C1,C41
`Chr2:72028901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C10
`Chr2:72028951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C56
`Chr2:72029444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B134,B16
`Chr2:72029500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B125,B54,B71,C4
`Chr2:72029569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C72,C75
`Chr2:72030022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B9,C26,C73,C86
`Chr2:72030554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C72
`Chr2:72030615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:72031153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792204.1

230 aa

115

230

zf-Di19

Di19_C

PF05605 zf-Di19 51-104 aa PF14571 Di19_C 124-224 aa

XP_057792205.1

221 aa

110

221

zf-Di19

Di19_C

PF05605 zf-Di19 42-95 aa PF14571 Di19_C 115-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792204.1`	Pfam	`PF05605`	zf-Di19	Domain	51	104	5.1e-24	85.0	Drought induced 19 protein (Di19), zinc-binding
`XP_057792204.1`	Pfam	`PF14571`	Di19_C	Family	124	224	2.2e-34	118.7	Stress-induced protein Di19, C-terminal
`XP_057792205.1`	Pfam	`PF05605`	zf-Di19	Domain	42	95	4.8e-24	85.1	Drought induced 19 protein (Di19), zinc-binding
`XP_057792205.1`	Pfam	`PF14571`	Di19_C	Family	115	215	1.9e-34	118.9	Stress-induced protein Di19, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936221.1
AATTACAATCAGACATCATCAAAAACGTCAAGCTGTCAGAAGACCAAATTCCACAAAACAAAAAAAGATGAAATGAAATAAAAAGAAGAATATAAAAGGTGTGTGGAAGACAACTCTCTGCTCCCTTTCGGTGGATTTTCATTTCACCTTGCAAAGGCAGGCAAGCGCAAGCCCCCCCTCCCATCTATTTCTCTCTCTTCATTTCATCTCACCGCCATCGTCGTCTCTCTCTCAACTCCTGTAAAATAATTCACAAATTA...

XM_057936222.1
GGAAGACAACTCTCTGCTCCCTTTCGGTGGATTTTCATTTCACCTTGCAAAGGCAGGCAAGCGCAAGCCCCCCCTCCCATCTATTTCTCTCTCTTCATTTCATCTCACCGCCATCGTCGTCTCTCTCTCAACTCCTGTAAAATAATTCACAAATTAAGGAAATCTTTGGGCAAGAATTTCATCAGAGCACCCTTGATTGGTTTGATAAGCTCTTGAGGAACAGCTCGGATTTGCAGAAAAAAGAAACCAAATTATAAATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009028
ATGGATGCTAATTCTTGGGCTGCTCGTTTGTCTTCTGCCTCCAAGCGCTATCAATCTGCTCTTCAATCTCGATCTGAAATGCTCATGGGCTTTGAGGAGATTGACATGGATGATGATATAAGAGAGGAATATCCGTGCCCTTTCTGTTCGGACTATTTTGATATTGTGGGACTCTGCTGCCACATTGATGATGAGCATCCTATAGAAGCCAAGAATGGGGTGTGTCCAGTTTGTGCGATGAGGGTGGGCGTTGATATGGT...

LOC131009028
ATGGATGCTAATTCTTGGGCTGCTCGTTTGTCTTCTGCCTCCAAGCGCTATCAATCTGCTCTTCAATCTCGATCTGGAATAAAATGGGATGGCTTTGATGCAGAAATGCTCATGGGCTTTGAGGAGATTGACATGGATGATGATATAAGAGAGGAATATCCGTGCCCTTTCTGTTCGGACTATTTTGATATTGTGGGACTCTGCTGCCACATTGATGATGAGCATCCTATAGAAGCCAAGAATGGGGTGTGTCCAGTTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792204.1
MDANSWAARLSSASKRYQSALQSRSGIKWDGFDAEMLMGFEEIDMDDDIREEYPCPFCSDYFDIVGLCCHIDDEHPIEAKNGVCPVCAMRVGVDMVAHITLQHGNIFKMQRKRKSRKSGSHSTLSLLRRELREGNLQSLFGGSSCIVSSNNAAPDPLLSSFILPMVEDYESIVPSHSSAESTTSKKSTTGSISERKPRPPPMSIKDQEEKAKRSDFVQGLVLSVMLDDNS

XP_057792205.1
MDANSWAARLSSASKRYQSALQSRSEMLMGFEEIDMDDDIREEYPCPFCSDYFDIVGLCCHIDDEHPIEAKNGVCPVCAMRVGVDMVAHITLQHGNIFKMQRKRKSRKSGSHSTLSLLRRELREGNLQSLFGGSSCIVSSNNAAPDPLLSSFILPMVEDYESIVPSHSSAESTTSKKSTTGSISERKPRPPPMSIKDQEEKAKRSDFVQGLVLSVMLDDNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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