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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005031`

染色体: Chr02 坐标: 72032822-72037578 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005031`
名称	SmilChr02G005031
描述	syntaxin-43-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72032822 - 72037578 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009001`
GeneID	`131009001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009001`
原始查询	`SmilChr02G005031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-43-like
产物	syntaxin-43-like
Arabidopsis	`AT3G05710` (SYP43) syntaxin of plants 43 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819740] identity=74.5; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0116300` - identity=73.5; qcov=1.03; evalue=9.64e-170; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012505 (endomembrane system); GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0048278 (GO:0048278)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05739 (SNARE); PF14523 (Syntaxin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792165.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057792165.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057792165.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057792165.1`
5	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057792165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72033147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:72034513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B128,B67
`Chr2:72035182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C48
`Chr2:72035248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:72036870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B109,B44,B98,D3
`Chr2:72037164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C72
`Chr2:72037189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792165.1

322 aa

161

322

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 79-184 aa PF05739 SNARE 230-305 aa

XP_057792166.1

322 aa

161

322

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 79-184 aa PF05739 SNARE 230-305 aa

XP_057792167.1

321 aa

160

321

Syntaxin_2

SNARE

PF14523 Syntaxin_2 78-183 aa PF05739 SNARE 229-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792165.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	79	184	7.2e-06	26.8	Syntaxin-like protein
`XP_057792165.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	230	305	2.6e-23	82.4	SNARE domain
`XP_057792166.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	79	184	7.2e-06	26.8	Syntaxin-like protein
`XP_057792166.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	230	305	2.6e-23	82.4	SNARE domain
`XP_057792167.1`	Pfam	`PF14523`	Syntaxin_2	Domain	78	183	7.2e-06	26.7	Syntaxin-like protein
`XP_057792167.1`	Pfam	`PF05739`	SNARE	Domain	229	304	2.6e-23	82.4	SNARE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936182.1
CATTTTCATTCTTCGTTTGTGCGAAAACTCACCGCGGCCCGTATCACGAAATTCGCCAACCAAATCAGGCCCGATTTCCAGCCCGAACACTTCCCATTCCTATCTGTCAGTTAACCCGGCCCGTTTAGAAGCCGGGCCAACCCAATTGCTCGCCATTTGCAGATCTATCATAAACTGAAGCAATTTCGTGATTTGATCATTATACGCGTTGGTAGATTCTGTGAAGATATTGATACGTCTTTTTTGTTTTAATGGCGACG...

XM_057936184.1
CATTTTCATTCTTCGTTTGTGCGAAAACTCACCGCGGCCCGTATCACGAAATTCGCCAACCAAATCAGGCCCGATTTCCAGCCCGAACACTTCCCATTCCTATCTGTCAGTTAACCCGGCCCGTTTAGAAGCCGGGCCAACCCAATTGCTCGCCATTTGCAGATCTATCATAAACTGAAGCAATTTCGTGATTTGATCATTATACGCGTTGGTAGATTCTGTGAAGATATTGATACGTCTTTTTTGTTTTAATGGCGACG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131009001
ATGGCGACGAGGAATCGGACGATTCTGTTTAGAAGGTATAGGGATGCGTTGAAGAGCGTAAGGGTTCCGGCGGGCTCGTCGCCCTCCAGCTCCGGCGGAAGAGCGGTGATCGAGCTCTCGACGGCGTCGTTGCTTAACCCTAACCGATCTTACACTCCTCTTAGCACTGAAGATCCCGGAACCTCCAGCAGGGGAACAGTTGCAGTAGGTTTACCACCAGCTTGGGTGGATGTATCTGAAGAAATAGCGACTAACATACA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057792165.1
MATRNRTILFRRYRDALKSVRVPAGSSPSSSGGRAVIELSTASLLNPNRSYTPLSTEDPGTSSRGTVAVGLPPAWVDVSEEIATNIQRVRGKMAELSKAHAKALMPSFGDGKEDQRQIEALTQEITDLLKKSEKRLQRLSTGGPSEDSNIRKNVQRSLATDLQTLSMELRKKQSTYLKRLRQQKEGSDGVDLEMNLNGSKSTRDDDDDMDDIGFSEHQMARLKKSEAFTAEREREIQQVVESVNELAQIMKDLSVLVIDQ...

XP_057792166.1
MATRNRTILFRRYRDALKSVRVPAGSSPSSSGGRAVIELSTASLLNPNRSYTPLSTEDPGTSSRGTVAVGLPPAWVDVSEEIATNIQRVRGKMAELSKAHAKALMPSFGDGKEDQRQIEALTQEITDLLKKSEKRLQRLSTGGPSEDSNIRKNVQRSLATDLQTLSMELRKKQSTYLKRLRQQKEGSDGVDLEMNLNGSKSTRDDDDDMDDIGFSEHQMARLKKSEAFTAEREREIQQVVESVNELAQIMKDLSVLVIDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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