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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005033`

染色体: Chr02 坐标: 72043132-72045964 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005033`
名称	SmilChr02G005033
描述	uncharacterized SmilChr02G005033
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72043132 - 72045964 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009015`
GeneID	`131009015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009015`
原始查询	`SmilChr02G005033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820313]; symbol=EIF3G1; hit=AT3G11400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	eukaryotic translation initiation factor 3G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820313]; symbol=EIF3G1; hit=AT3G11400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11400` (EIF3G1) eukaryotic translation initiation factor 3G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820313] identity=75.9; qcov=1; evalue=5.62e-164; confidence=high
Rice	`Os02g0788400` (eIF-3g) - identity=75.9; qcov=1.01; evalue=6.64e-162; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005852 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF12353 (eIF3g)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792181.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057792181.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792181.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057792181.1`
5	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057792181.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72043731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,D10
`Chr2:72043743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87
`Chr2:72045565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr2:72045615`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B67,C19,C71
`Chr2:72045615`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B67,C19,C71
`Chr2:72045616`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B67,C19,C71
`Chr2:72045616`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B67,C19,C71
`Chr2:72045645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C19,C71
`Chr2:72045662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B73,C19,C71
`Chr2:72045671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B73,C19,C71
`Chr2:72045675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B73,C19,C71
`Chr2:72045676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792181.1

289 aa

144

289

eIF3g

RRM_1

PF12353 eIF3g 31-158 aa PF00076 RRM_1 210-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792181.1`	Pfam	`PF12353`	eIF3g	Family	31	158	5.2e-34	118.0	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G
`XP_057792181.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	210	276	3.8e-21	75.5	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936198.1
TGCCTGCCACCCCAAAATTCACCTCACCAGAAAAAAACCCTAATTCTTTGCGACCTTCAATCTTCATAATGGTGAGAGAAGAGCAACCCAACAAGCTGCGATGGGGGGAGCTGGACGAGGACGACGGCGAGGATTTGGATTTCCTGCTGCCGCCGAAGCAGGTCATTGGTCCCGACGAGAGCGGGATTAAGAAGGTGATTGAATACAAGTTCAGCGATGACGGAAACAAGGTTAAGATTACCACCACCACGCGCATCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009015
ATGGTGAGAGAAGAGCAACCCAACAAGCTGCGATGGGGGGAGCTGGACGAGGACGACGGCGAGGATTTGGATTTCCTGCTGCCGCCGAAGCAGGTCATTGGTCCCGACGAGAGCGGGATTAAGAAGGTGATTGAATACAAGTTCAGCGATGACGGAAACAAGGTTAAGATTACCACCACCACGCGCATCCGGAAGCTCGCCAACGCCCGCCTCAGCAAGCGCGCCGTCGAGCGCCGCTCCTGGCCCAAGTTCGGCGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792181.1
MVREEQPNKLRWGELDEDDGEDLDFLLPPKQVIGPDESGIKKVIEYKFSDDGNKVKITTTTRIRKLANARLSKRAVERRSWPKFGDAVHEAVGARLTMVSTEEIILERPRAAGTKAEEAKAAGDPLAQMGKGGAVLMVCRTCGKKGDHWTSRCPYKDLAQPSETFVDKPPTETNAAPGSTKGAYVPPSMRGGVPERSGTDMRRRNEENSVRVTNLSEDTREPDLLELFRPFGSVSRVYVAIDQKTGTSRGFGFVNFVNRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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