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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005044`

染色体: Chr02 坐标: 72152168-72164421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005044`
名称	SmilChr02G005044
描述	protein TRANSPARENT TESTA 9
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72152168 - 72164421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008915`
GeneID	`131008915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008915`
原始查询	`SmilChr02G005044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TRANSPARENT TESTA 9
产物	protein TRANSPARENT TESTA 9
Arabidopsis	`AT3G28430` (AT3G28430) CLEC16A-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822473] identity=60.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0298600` - identity=55.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005770 (late endosome); GO:0008333 (endosome to lysosome transport); GO:0016197 (endosomal transport); GO:0036020 (endolysosome membrane); GO:1901096 (regulation of autophagosome maturation)
KEGG	-
Pfam	PF09758 (FPL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792014.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057792014.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792014.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057792014.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057792014.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72154919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:72155094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C32,C37,C68
`Chr2:72155109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B30,B79,C79
`Chr2:72157022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B98,C2,C32,C37,C68
`Chr2:72157076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C32,C37,C68
`Chr2:72157692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:72157708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B64,C14,C44
`Chr2:72157715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B25,B34,C35
`Chr2:72158780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:72160516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B60,B79,C57
`Chr2:72162322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:72162323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792014.1

834 aa

417

834

FPL

PF09758 FPL 42-192 aa

XP_057792015.1

833 aa

416

833

FPL

PF09758 FPL 42-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792014.1`	Pfam	`PF09758`	FPL	Family	42	192	5.3e-54	183.0	Uncharacterised conserved protein
`XP_057792015.1`	Pfam	`PF09758`	FPL	Family	42	192	5.3e-54	183.0	Uncharacterised conserved protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936031.1
TCGAAAATATGAATTTTATTTAACAGATTTGAGTTGGTGAAAATCCTACAGCTTATAACTGACGATGAATTTAAAATTACATCTGACAGGTCGGCACAGCACTATACACCTCCACTCGTCAATGTCAAGGATCCGACCCGCGAACCCATTTGCTCGATCCGGATGCTGATTACTCCCATCTCTGATCCCACCATCGCCTTTCTGGATATTCCTTTATTTGATTTGATTCATTGCTTCTTGGCGCATCTTAATTTCCGGTG...

XM_057936032.1
TCGAAAATATGAATTTTATTTAACAGATTTGAGTTGGTGAAAATCCTACAGCTTATAACTGACGATGAATTTAAAATTACATCTGACAGGTCGGCACAGCACTATACACCTCCACTCGTCAATGTCAAGGATCCGACCCGCGAACCCATTTGCTCGATCCGGATGCTGATTACTCCCATCTCTGATCCCACCATCGCCTTTCTGGATATTCCTTTATTTGATTTGATTCATTGCTTCTTGGCGCATCTTAATTTCCGGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008915
ATGTGGTTTTCCTTTTGGCGATCCAGGGATAGATTGTCGTTAGATGAACTCAGATTCATAGTTGATCAACTGATAAAAGTTCAAGTTGTAAATGAGGTTAACAAAGACTTTGTCATTGAGGCTTTGAGATCTATTGCAGAGTTGATAACATATGGTGACCAGCACGATGCTGCCTATTTCGAGTTTTTCATGGAGAAACAGGTGATGGGCGAGTTTGTACGCATATTAAGAATATGTAAATCTCTGATTGTCTCACGCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792014.1
MWFSFWRSRDRLSLDELRFIVDQLIKVQVVNEVNKDFVIEALRSIAELITYGDQHDAAYFEFFMEKQVMGEFVRILRICKSLIVSRQLLQTMSIMIQNLKSDHSIYYMFSNEHVNYLIAYPFDFRNEELLSYYISFLRAISGKLNKDTISLLVKTESDDVVDFPLYVEAIRFAFHEESMIRTAVRALTLNVYHVGDDTVNRFVSRAPHSDYFLKLIEFFRDRCIHLNSIVSNAKKSLNAELSSSILSAVDEIEDNLYYFS...

XP_057792015.1
MWFSFWRSRDRLSLDELRFIVDQLIKVQVVNEVNKDFVIEALRSIAELITYGDQHDAAYFEFFMEKQVMGEFVRILRICKSLIVSRQLLQTMSIMIQNLKSDHSIYYMFSNEHVNYLIAYPFDFRNEELLSYYISFLRAISGKLNKDTISLLVKTESDDVVDFPLYVEAIRFAFHEESMIRTAVRALTLNVYHVGDDTVNRFVSRAPHSDYFLKLIEFFRDRCIHLNSIVSNAKKSLNAELSSSILSAVDEIEDNLYYFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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