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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005052`

染色体: Chr02 坐标: 72231550-72238294 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005052`
名称	SmilChr02G005052
描述	uncharacterized SmilChr02G005052
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72231550 - 72238294 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008932`
GeneID	`131008932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008932`
原始查询	`SmilChr02G005052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsNTP9; symbol=OsNTP9; hit=Os08g0559900; species=rice; confidence=medium
产物	OsNTP9; symbol=OsNTP9; hit=Os08g0559900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G45750` (AT3G45750) Nucleotidyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823717] identity=45.6; qcov=0.685; evalue=1.99e-114; confidence=high
Rice	`Os08g0559900` (OsNTP9) - identity=53.3; qcov=0.565; evalue=4.95e-123; confidence=medium
GO	GO:0016779 (nucleotidyltransferase activity); GO:0031123 (RNA 3'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF22600 (MTPAP-like_central)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057792036.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792036.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057792036.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057792036.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057792036.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72233086`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C24,C44,C50
`Chr2:72233086`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C24,C44,C50
`Chr2:72233089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr2:72233827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr2:72237052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:72237060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C22
`Chr2:72237060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:72237584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B55,C45
`Chr2:72237793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,C29,C40,C62,C72
`Chr2:72237992`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B121,B8
`Chr2:72237992`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B121,B8
`Chr2:72238051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B60,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792036.1

625 aa

312

625

MTPAP-like_central

PF22600 MTPAP-like_central 34-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792036.1`	Pfam	`PF22600`	MTPAP-like_central	Domain	34	177	4.9e-26	92.2	Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial-like, central palm domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936053.1
GTGCAAACGCTATTGAACTCTATGGGATAGATGCGCCATAGACCTGAATGGGATCTACACCTAATTTTTCAGTATACGGTTAAATTTAATTGGATATTGAAATTCGAGAATTGAGAGGCGAGCCGAGTTGTATGTATTGTTTGTTTGCATTGCATCCACCTTCTTTACTGCCCAATCCATCCACCCTAAAATTGAATTGACATAGAACCCATCACAAATATTTGGCCAATTCTACCATTATGTTTATTTAATCGTATGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008932
ATGGCGTTGCGCGCAAAAGTTCTGCAGAAGAAGGCAGAAAAGTTTGAACTGAAGAAATTGCAGGTTATTAAAGTAACTAAGGAAGGAGTATCTTCCCTTGACACCCTGCTTCAAGATGTTTACGCCAATCGACGACCAAAACAAACTGATTATGAAGCTCGAAGAGATCTAATTCGTGTCTTCAATGAGATTGCAAAGGAACTTTACGGTACCTCAAAGGATATTCCCATCGTGGTTGAATTTGGTTCTTTTGTAATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792036.1
MALRAKVLQKKAEKFELKKLQVIKVTKEGVSSLDTLLQDVYANRRPKQTDYEARRDLIRVFNEIAKELYGTSKDIPIVVEFGSFVMDLFSTTSDLDLSVNFSTGGVDFPREKKIQTLRKFARKLYAIQSMGHVSGVLPITTAKVPILKCVDRGTGVECDISVENRDGISKSQIIWIISSIDERFKKLSFLMKTWAKAHNINSSKDKTLNSLSIILLVAFHLQTRTPPILPPFSAIFKDGTDPATVEKSMPNFLSYGKRNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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