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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005060`

染色体: Chr02 坐标: 72297167-72298973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005060`
名称	SmilChr02G005060
描述	CAX-interacting protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72297167 - 72298973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008991`
GeneID	`131008991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008991`
原始查询	`SmilChr02G005060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CAX-interacting protein 4-like
产物	CAX-interacting protein 4-like
Arabidopsis	`AT2G28910` (CXIP4) CAX interacting protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817440] identity=68.8; qcov=0.506; evalue=3.49e-69; confidence=medium
Rice	`Os09g0103700` - identity=62.5; qcov=0.421; evalue=7.81e-52; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13917 (zf-CCHC_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792137.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057792137.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057792137.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792137.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792137.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72297742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr2:72297829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B129,B54,B8,C40
`Chr2:72298003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B17,B64
`Chr2:72298060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:72298063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C48
`Chr2:72298220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C84
`Chr2:72298233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B76,C24,C81
`Chr2:72298314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr2:72298443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B4,B9
`Chr2:72298470`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A7,B10,B105,B111,B113,B118,B126,B131,B134,B135,B140,B16,B26,B33,B47,B6,B62,B71,B72,B86,B94,B95,C1,C15,C24,C37,C38,C48,C61,C62,C77,D9
`Chr2:72298473`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A13,A7,B10,B105,B111,B113,B126,B131,B134,B135,B140,B16,B26,B33,B47,B6,B62,B71,B72,B86,B94,B95,C1,C15,C24,C38,C48,C61,C62,C77,D9
`Chr2:72298544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B54,B8,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792137.1

342 aa

171

342

zf-CCHC_3

PF13917 zf-CCHC_3 84-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792137.1`	Pfam	`PF13917`	zf-CCHC_3	Domain	84	103	2.9e-06	27.7	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936154.1
ATCTCCACCGACTTCACTTAATTACCTTTTTTAATTTACTATATTTATCTAATTCTTTCATGTACTTGTCGTTTGCCAATTGGGATCTGCTGAGTTCCGATCACCACAAATTCACGCCGCCCCAATTCTGAGATAATCGGAAGCACAATTTCAAACGCTTCTCTCCCGCTACAAAACTCGTCGATTTTTCTCCGACGGAAATCTAGATCTCGCCAAGATGCCGGCGACCGCGGGGAGGGTTCGCATGCCGGCGAACAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008991
ATGCCGGCGACCGCGGGGAGGGTTCGCATGCCGGCGAACAACCGGGTGCACAGCAGCGCCGCCCTACAGACCCACGGCATATGGCAGAGTGCAATTGGGTACGATCCCTACGCGCCCAACAAAGAAGAGAAGAGCAACGCCTCCGCTCAGAAGAGCGCCGCCGCCTCGGAAGGCGAACAGGAAAACGCGTATGCTAGTTTTCAGGGTTTACTCGCTCTTGCTCGCATCACGGGATCGAATGCCGACGAGGCTCGTGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792137.1
MPATAGRVRMPANNRVHSSAALQTHGIWQSAIGYDPYAPNKEEKSNASAQKSAAASEGEQENAYASFQGLLALARITGSNADEARGSCKKCGRVGHLTFQCRNFLSAKSDDDKASKDNDAIQAAVLSGLEKLKGEKLKARAAAGESEESSEEESESSDTDYDSEMERAVAQKFGRKASASGGKLRSSKSRKRSDSDELDNDDGSESDARERKKKEKRERGRSKNRKSAKRRYSDSDDEDSSRKKRRKEKRRKRDDDDSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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