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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005068`

染色体: Chr02 坐标: 72342434-72344997 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005068`
名称	SmilChr02G005068
描述	REF/SRPP-like protein At3g05500
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72342434 - 72344997 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009023`
GeneID	`131009023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009023`
原始查询	`SmilChr02G005068`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	REF/SRPP-like protein At3g05500
产物	REF/SRPP-like protein At3g05500
Arabidopsis	`AT3G05500` (AT3G05500) Rubber elongation factor protein (REF) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819715] identity=47; qcov=0.921; evalue=4.5e-69; confidence=high
Rice	`Os07g0671800` - identity=44; qcov=0.857; evalue=5.02e-56; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05755 (REF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792195.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792195.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057792195.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792195.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792195.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72342781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C53
`Chr2:72342815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B127,C18
`Chr2:72342853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:72342864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:72342898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:72342925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr2:72343063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:72343087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87
`Chr2:72343132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:72344607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792195.1

252 aa

126

252

REF

PF05755 REF 18-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792195.1`	Pfam	`PF05755`	REF	Family	18	232	8.7e-69	232.2	Rubber elongation factor protein (REF)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936212.1
TTAATTTCACACACACTGCCCACGCATTTATTCCACACACACACATAAATACATAATACATCACCTCTCTCTCTATATATCCAACGCGACACAAACAAATCGATTTTCCCTCGAGATCGGAAGAAGAAGAAGAACCAGACAGGAGGAGATTAGCGCTGTTGCAATTCATCATGGCCAAAACAGATTGCAATCTCCAACAACCTAAATCCGCGAGGGGCGATGAGAACAGGCCGAGGCTCAAGTACTTGGATTTCGTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009023
ATGGCCAAAACAGATTGCAATCTCCAACAACCTAAATCCGCGAGGGGCGATGAGAACAGGCCGAGGCTCAAGTACTTGGATTTCGTGGTGGTCGCCGCCCTTCAAGCGCTGATGTTCGTCGCCAGCATCTACTGTTTCGCCAAGGAGAGATCGGGCCGGCTCAAGCCCGGCATTGACGTCGTTGAGGGCTCTGTTAAGAACGTCATCGGCCCGCTTTACGCTAAATCACACCATCTCCCCATTCAAGTCCTCAACTTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792195.1
MAKTDCNLQQPKSARGDENRPRLKYLDFVVVAALQALMFVASIYCFAKERSGRLKPGIDVVEGSVKNVIGPLYAKSHHLPIQVLNFADRKVDESVHKVQKCVPSTLRSASFKAYNHARRAPIAARCVMADVKKTGMVETASELAKSVYAKYEPVAKDFYTKYEPVTEEYALYLWRLLNQYALFQRAALAAGPLAGYCSEMYNQKVEVAAKRGYKVAAHLPIIPIEKIAEALRTENMKPVVIDGGRGEEEIAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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