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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005071`

染色体: Chr02 坐标: 72374946-72376675 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005071`
名称	SmilChr02G005071
描述	dormancy-associated protein homolog 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72374946 - 72376675 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009069`
GeneID	`131009069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009069`
原始查询	`SmilChr02G005071`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dormancy-associated protein homolog 3
产物	dormancy-associated protein homolog 3
Arabidopsis	`AT1G56220` (AT1G56220) Dormancy/auxin associated family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842075] identity=57.5; qcov=1.09; evalue=4.68e-36; confidence=medium
Rice	`Os03g0342900` - identity=51.9; qcov=1.03; evalue=1.78e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05564 (Auxin_repressed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792250.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792250.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792250.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792250.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792250.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72375123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B76,C1
`Chr2:72375140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B97
`Chr2:72375140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr2:72375599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C57
`Chr2:72375611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A4,B27,B70,D11
`Chr2:72375626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,D10
`Chr2:72375713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C14,C83
`Chr2:72376486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B78,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792250.1

128 aa

128

Auxin_repressed

PF05564 Auxin_repressed 7-84 aa

XP_057792252.1

127 aa

127

Auxin_repressed

PF05564 Auxin_repressed 7-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792250.1`	Pfam	`PF05564`	Auxin_repressed	Family	7	84	7.9e-10	40.1	Dormancy/auxin associated protein
`XP_057792252.1`	Pfam	`PF05564`	Auxin_repressed	Family	7	84	8.2e-10	40.0	Dormancy/auxin associated protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936267.1
CTCGTCCCAATCCAAAATATCTGCTCGACTTTTAACGCCTCCGCCCTTTTAAATAGCACCACCATCGCATCCTGGGTTTTAGCAGCCGGCCGAAAACCTCAGTCTCAGTGACTCGGTAGCTTGCAAGCTCTTCGTGCGCTTGATTTGCTAACTTGCGCTGTTCGTGCGAACCATGGGGTTGCTTGACCACCTCTGGGACGACACCGTCGCCGGTCCCCGGCCGGATAGCGGCCTCGGGAAACTGAGAAAACACTCCACTT...

XM_057936269.1
GTCCCAATCCAAAATATCTGCTCGACTTTTAACGCCTCCGCCCTTTTAAATAGCACCACCATCGCATCCTGGGTTTTAGCAGCCGGCCGAAAACCTCAGTCTCAGTGACTCGGTAGCTTGCAAGCTCTTCGTGCGCTTGATTTGCTAACTTGCGCTGTTCGTGCGAACCATGGGGTTGCTTGACCACCTCTGGGACGACACCGTCGCCGGTCCCCGGCCGGATAGCGGCCTCGGGAAACTGAGAAAACACTCCACTTTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009069
ATGGGGTTGCTTGACCACCTCTGGGACGACACCGTCGCCGGTCCCCGGCCGGATAGCGGCCTCGGGAAACTGAGAAAACACTCCACTTTTAGCGCGCGATCCAACTCCGGCAAGGAAGTTGAGAACAGCAACATACAATCGTTGGGAGGGGAGGCTGCGGACGATGCAACTCGAGTGACGAGGAGCATAATGATTGTGAAGCCGCTGCAGGCGAGCCTGCAGAAAGATTCGCCGCCGGTTTCCCCCGCCGGAAGCACACC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792250.1
MGLLDHLWDDTVAGPRPDSGLGKLRKHSTFSARSNSGKEVENSNIQSLGGEAADDATRVTRSIMIVKPLQASLQKDSPPVSPAGSTPPVSPFGGGGREAFRFRRGSGSFSFEKASGVGPRSPPPPYDL

XP_057792252.1
MGLLDHLWDDTVAGPRPDSGLGKLRKHSTFSARSNSGKEVENSNIQSLGGEAADDATRVTRSIMIVKPLQASLQKDSPPVSPAGSTPPVSPFGGGREAFRFRRGSGSFSFEKASGVGPRSPPPPYDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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