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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005076`

染色体: Chr02 坐标: 72398080-72401174 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005076`
名称	SmilChr02G005076
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 9-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72398080 - 72401174 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009074`
GeneID	`131009074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009074`
原始查询	`SmilChr02G005076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 9-like
产物	serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 9-like
Arabidopsis	`AT5G27840` (TOPP8) Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832846] identity=85.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0349400` (OsPP5) - identity=72.9; qcov=1; evalue=3.63e-176; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos); PF16891 (STPPase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792261.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792261.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792261.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057792261.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057792261.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72398389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:72399799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C4,C7
`Chr2:72400461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr2:72400473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr2:72400647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792261.1

317 aa

158

317

STPPase_N

Metallophos

PF16891 STPPase_N 13-57 aa PF00149 Metallophos 59-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792261.1`	Pfam	`PF16891`	STPPase_N	Family	13	57	1.5e-18	67.7	Serine-threonine protein phosphatase N-terminal domain
`XP_057792261.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	59	252	5.5e-50	171.2	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936278.1
GAGCACTCATAATTGACAGGAAAATGTTAAATGCCCAAATTGACCGAACGATAATAGTAATCACTTTTCGATTATGCACGCACCAAACCAAATCCATTCTTGATTCTTCTCTCTCACATAACCCACCATCAATTTGAAATTTTGATGATAACCCTTTTTCATTTCTGCGCCTATCTAATCTGAGGGAGATTGAATTGAAATTCACCCAAAATGATGACAATAGAAGGAAATATGGATAAGGGGGTGTTGGATGACATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009074
ATGATGACAATAGAAGGAAATATGGATAAGGGGGTGTTGGATGACATAATTGGGCGGCTGTTGGAAGGCAAAGGAGGGAAACAGGTGCAGCTTTCGGAGGCGGAGATCCGCCAGCTCTGCGTCAACGCTCGCCAAATTTTCCTCTCCGAGCCCAACCTCCTTCAACTCCGCGCCCCTATTAGGATCTGCGGAGACATACATGGCCAGTACCAGGACCTATTAAGGCTCTTCGAATATGGTGGGTACCCTCCTGGCGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792261.1
MMTIEGNMDKGVLDDIIGRLLEGKGGKQVQLSEAEIRQLCVNARQIFLSEPNLLQLRAPIRICGDIHGQYQDLLRLFEYGGYPPGANYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIRYPDRVYLLRGNHEDAKINRIYGFYDECKRRFNVRLWKIFTECFNCLPVSALIDEKILCMHGGLSPDLKRLDQINEITRPTDIPDSGLLCDLLWSDPDPRIRGWTDSDRGVSCVFGADVVAEFLQKNDLDLICRGHQVVEDGYEFFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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