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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005097`

染色体: Chr02 坐标: 72534141-72539706 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005097`
名称	SmilChr02G005097
描述	protein trichome birefringence-like 43
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72534141 - 72539706 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009093`
GeneID	`131009093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009093`
原始查询	`SmilChr02G005097`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 43
产物	protein trichome birefringence-like 43
Arabidopsis	`AT2G30900` (TBL43) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 43 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817640] identity=54.6; qcov=1.03; evalue=1.09e-139; confidence=high
Rice	`Os01g0652100` (OsTBL21) - identity=50.5; qcov=0.933; evalue=1.7e-118; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792286.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792286.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792286.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792286.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792286.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72534323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,C28,C37,C39,C48
`Chr2:72534357`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B121
`Chr2:72534357`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B121
`Chr2:72534390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A2,A21,C44,C45
`Chr2:72534390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A21,C44,C45
`Chr2:72534461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C2,C32,C68
`Chr2:72534521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:72534530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B88,C62
`Chr2:72534534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr2:72538078`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr2:72538078`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr2:72538097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C48,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792286.1

344 aa

172

344

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 28-77 aa PF13839 PC-Esterase 83-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792286.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	28	77	1.9e-21	76.9	PMR5 N terminal Domain
`XP_057792286.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	83	335	6.8e-83	279.6	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936303.1
CACGACTTTCGCAATTGGTCGAAAAGAGCAGATTTTCCAGCCAAGTTGCTTGCCTCCTTTCTTAATCACTCCATAATATCATTTTCCCACTTTATCACCCATGAAAACACATTCATCTTCTATATATACCACACATACACATACATACATATACAATACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCAATGGGGTTGGCATTGGTGGGTGCATTACTGCTAGTAGTGGCGGTTGCTGTATTGAAGGTGGATGCAAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009093
ATGGGGTTGGCATTGGTGGGTGCATTACTGCTAGTAGTGGCGGTTGCTGTATTGAAGGTGGATGCAAAAGTTGCGCAGAAAGGGTGTGATATATTCGACGGCGATTGGGTTTTGGACAGCTCCTATCCTTACTACCAGTCTTCGCAGTGCCCTTTCATCGAAGAGCAGTTCGATTGCCGCCGCAAAGGCCGCCCCGACACCAACTACACCAACTACAAATGGCAGCCCTCCGCCGCCGGCTGCCTTTTGCCCCGGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792286.1
MGLALVGALLLVVAVAVLKVDAKVAQKGCDIFDGDWVLDSSYPYYQSSQCPFIEEQFDCRRKGRPDTNYTNYKWQPSAAGCLLPRLNGVEFLRKLKGKQLMFVGDYLSLNQWQSLTCMLHVAVPNAKYTSKTLQGLSTFTFPDYDVSIKFYRNAFLVDIKNERRGRVLMLDSISSSQIWGGMDYVIFDSWHWWLHAGRKQPWDWVVYGNTTVKDIDRMVAYEEALNTWAKWIDANIDPTKTQVFFQGVSPDHDRCTGHTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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