当前解析结果
SmilChr02G005103| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005103 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005103 |
| 描述 | magnesium transporter MRS2-4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 72570454 - 72573569 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009101 |
|---|---|
| GeneID | 131009101 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009101 |
| 原始查询 | SmilChr02G005103 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | magnesium transporter MRS2-4-like |
| 产物 | magnesium transporter MRS2-4-like |
| Arabidopsis | AT3G58970 (MGT6)magnesium transporter 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825066] identity=53.3; qcov=0.992; evalue=7.74e-131; confidence=high |
| Rice | Os03g0137700 (OsMRS2-5)- identity=40.7; qcov=0.987; evalue=4.09e-86; confidence=medium |
| GO | GO:0015095 (magnesium ion transmembrane transporter activity); GO:0015693 (magnesium ion transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF22099 (MRS2-like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009101 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057792298.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057792298.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792298.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792298.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792298.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:72570600 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B32,C29,C45,D5 |
Chr2:72570609 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A14 |
Chr2:72570663 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B3,C56 |
Chr2:72570783 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr2:72570810 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,B73 |
Chr2:72571045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B35 |
Chr2:72571667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,C60,C74 |
Chr2:72571684 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C34,C60,C87 |
Chr2:72571700 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B108,B61,C30,C62,C87 |
Chr2:72571733 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,B94 |
Chr2:72571737 |
G |
GCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C61 |
Chr2:72571737 |
G |
GCA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C61 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792298.1PF22099
MRS2-like 65-321 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792298.1 |
Pfam | PF22099 |
MRS2-like | Family | 65 | 321 | 2.2e-29 | 103.1 | Magnesium transporter MRS2-like |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。