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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005106`

染色体: Chr02 坐标: 72586150-72586944 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005106`
名称	SmilChr02G005106
描述	(-)-isopiperitenol/(-)-carveol dehydrogenase, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72586150 - 72586944 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009103`
GeneID	`131009103`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009103`
原始查询	`SmilChr02G005106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(-)-isopiperitenol/(-)-carveol dehydrogenase, mitochondrial-like
产物	(-)-isopiperitenol/(-)-carveol dehydrogenase%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G47140` (SDR5) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819327] identity=48.6; qcov=0.943; evalue=2.89e-73; confidence=high
Rice	`Os03g0833100` - identity=50.8; qcov=0.985; evalue=4.57e-72; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009103

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792300.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057792300.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057792300.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792300.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72586153`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A24,A4,A6,B11,B117,B126,B133,B135,B139,B17,B2,B22,B34,B35,B49,B68,B7,B76,B8,B80,B82,B83,B89,C19,C23,C3,C37,C59,C7,C76,C82,D5,D9
`Chr2:72586199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B3,B53,B61,B75
`Chr2:72586200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,C2,C32,C68,C83
`Chr2:72586222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:72586234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B25
`Chr2:72586234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:72586296`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B73,C35
`Chr2:72586296`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B73,C35
`Chr2:72586399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B36,B84
`Chr2:72586426`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	113	A1,A11,A15,A18,A2,A24,A4,A7,B100,B101,B103,B104,B106,B11,B112,B113,B114,B117,B122,B123,B125,B127,B13,B130,B134,B136,B140,B16,B17,B20,B23,B25,B3,B30,B32,B34,B36,B37,B4,B40,B41,B46,B5,B53,B56,B57,B60,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B74,B76,B80,B83,B84,B89,B9,B90,B92,B93,B95,B97,B98,C1,C11,C14,C21,C23,C3,C31,C32,C35,C38,C39,C4,C41,C44,C47,C48,C5,C53,C54,C57,C61,C62,C63,C64,C66,C68,C69,C73,C74,C76,C79,C8,C80,C83,C85,C87,D1,D11,D2,D3,D6,D7,D9
`Chr2:72586430`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A14,A15,A24,A3,A4,A6,A8,B1,B107,B11,B111,B112,B114,B117,B119,B12,B123,B126,B128,B132,B133,B135,B138,B139,B16,B17,B2,B22,B26,B29,B34,B35,B36,B37,B4,B47,B49,B51,B55,B58,B6,B63,B68,B69,B7,B71,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B89,B91,B93,B97,C18,C19,C2,C23,C28,C3,C30,C33,C37,C39,C40,C49,C53,C55,C59,C61,C62,C63,C67,C7,C75,C76,C77,C78,C81,C84,C87,D1,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr2:72586587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B55,B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792300.1

264 aa

132

264

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 8-198 aa PF08659 KR 11-173 aa PF13561 adh_short_C2 16-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792300.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	8	198	9e-45	153.3	short chain dehydrogenase
`XP_057792300.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	11	173	8.5e-10	39.5	KR domain
`XP_057792300.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	16	253	1.9e-55	188.8	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936317.1
TAATAAATGAAGCTTGAAGGCAAAGTAGCAATTGTAACAGGCGGCGCCAGCGGCATAGGCGAGACCACCGCCCACCTTTTCGCCCAGTACGGCGCCCGCGCGGTGGTGATCGCCGACATCGAAGCCGAGAAGGGCCGCGCCGTGGCCGAATCCATCGGCCTGCAGCGCTGCAGCTACGTCCACTGCGACGTCGCTGACGAGGAACAGGTTAAGTCCATGGTAGATTGGACCGCCACAACGTACGGCGGCCTCGACATAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009103
TAATAAATGAAGCTTGAAGGCAAAGTAGCAATTGTAACAGGCGGCGCCAGCGGCATAGGCGAGACCACCGCCCACCTTTTCGCCCAGTACGGCGCCCGCGCGGTGGTGATCGCCGACATCGAAGCCGAGAAGGGCCGCGCCGTGGCCGAATCCATCGGCCTGCAGCGCTGCAGCTACGTCCACTGCGACGTCGCTGACGAGGAACAGGTTAAGTCCATGGTAGATTGGACCGCCACAACGTACGGCGGCCTCGACATAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792300.1
XXMKLEGKVAIVTGGASGIGETTAHLFAQYGARAVVIADIEAEKGRAVAESIGLQRCSYVHCDVADEEQVKSMVDWTATTYGGLDIMFSNAGTGSSSAQAILEMDLSEYDRVMRVNARSMAVCVKQAARKMVELGTRGAIICTSSAAAERGAVNVTDYVMSKRAVLGLVRSASMQLGAHGIRVNSVSPGAVLTPLAAKAGLVTAVDVENYVGRFTSLKGVALKAENVAEAVAFLASDEAAFVTGVDLGVDGGMICMPFDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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