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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005118`

染色体: Chr02 坐标: 72677708-72679716 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005118`
名称	SmilChr02G005118
描述	subtilisin-like protease SBT4.3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72677708 - 72679716 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009113`
GeneID	`131009113`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009113`
原始查询	`SmilChr02G005118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT4.3
产物	subtilisin-like protease SBT4.3
Arabidopsis	`AT4G00230` (XSP1) xylem serine peptidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827949] identity=44.8; qcov=0.707; evalue=3.46e-14; confidence=low
Rice	`Os01g0278950` (OsSub1) - identity=45.5; qcov=0.715; evalue=1.88e-11; confidence=low
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF05703 (Auxin_canalis)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009113

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057792313.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057792314.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057792314.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057792313.1`
5	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057792314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72677846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B47,C45
`Chr2:72678033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C86
`Chr2:72678245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792314.1

123 aa

123

Auxin_canalis

PF05703 Auxin_canalis 1-30 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792314.1`	Pfam	`PF05703`	Auxin_canalis	Family	1	30	1.9e-05	25.4	Auxin canalisation

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936330.1
AAAATTGCGTCGTCTCTATCAAAATTCAGATTTACTCAAAATCCAAATTTTCTCCCTCACGCAATATGTTCTCTCTCCCTCCCTCTCTGCCGTTTCCTTCTCCCAAATTTCTCCGGCGAACGTCGCCGGTTCTCGTCGCCTCCGGCGCGGCGAGGCTGGCGTCTCTCTCCCCTCCTCCTTTCTTTCTTTTTTCTTTCCCTTAATTTAAATTAGTAACTACCTAGGATTTTTAAATCTTGTTCAATCCTGTTCTCCGACGA...

XM_057936331.1
AGGTAAAATGCTTCTTATAAGTTTTGGTGGTTTATTTACTTATATTTTCACTTTTTTCTGGATCTGGAAGGCTTATGATTGTTGCTTTGAGTCTGAGTTCATGAATTTCTTCTAGTTATTGATGGAGATTTCGTGTATTCCGTAATATTATAGAATCATTGGCGTTGTTATTGATTAAATTATTGCTCGAGTCTGACAATTGATCCTTATTTTAAGTGATTTTGTTCTGCATTACACGAATTCATCCGCAGAAATTTGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009113
ATGACCAAGACTGACATGGCGGTGGCCTCGGCTGCAACACTAGTGGCTGCTGCACAGTGTGTTGAGGCGGCTGAGGCAGCCGTTGGCGCAGCCGGAGCTATACTGTACGAGGATCGGTTAAGAGATGTGGCTCTCTCTTTTCCCCTCCCGGCCTCTTACTTGGGATCACTTGATGGTGCTCAAGTTTATGATTATATCAATAGAACTAGGAATCCAACAGCTACCATTTTGAGGAGTGATGAAGTCAATGAAACAATGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792313.1
MTKTDMAVASAATLVAAAQCVEAAEAAVGAAGAILYEDRLRDVALSFPLPASYLGSLDGAQVYDYINRTRNPTATILRSDEVNETMAPFVVSFSSRGPNPITMDILKPDVSAPGVDIIAAWSEANTASGYPEDPRVVGCRMFDVGCLYDGYFFNVG

XP_057792314.1
MTKTDMAVASAATLVAAAQCVEAAEAAVGAAGAILYEDRLRDVALSFPLPASYLGSLDGAQVYDYINRTRNPTATILRSDEVNETMAPFVVSFSSRGPNPITMDILKRGRRLIRRRDILKIQE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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