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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005131`

染色体: Chr02 坐标: 72770229-72771620 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005131`
名称	SmilChr02G005131
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g17530-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72770229 - 72771620 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009961`
GeneID	`131009961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009961`
原始查询	`SmilChr02G005131`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g17530-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g17530-like
Arabidopsis	`AT3G23260` (AT3G23260) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821905] identity=25.5; qcov=0.559; evalue=8.71e-13; confidence=low
Rice	`Os09g0479100` (OsFbox492) - identity=24.8; qcov=0.898; evalue=2.34e-14; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793340.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793340.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793340.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793340.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72770356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:72770357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C79
`Chr2:72770403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:72770448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B94,C64,C73,C84
`Chr2:72770463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B20,B40,C27
`Chr2:72770496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	139	A1,A11,A13,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A3,A6,B100,B109,B11,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B130,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B21,B23,B24,B28,B29,B3,B30,B35,B36,B37,B43,B44,B46,B47,B49,B50,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B63,B64,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B84,B85,B86,B88,B9,B90,B94,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C20,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C31,C34,C36,C38,C39,C40,C43,C44,C45,C47,C49,C5,C50,C52,C53,C55,C56,C57,C62,C63,C70,C72,C74,C75,C76,C8,C80,C83,C84,C86,D1,D2,D3,D4,D5,D6
`Chr2:72770499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B72,C65
`Chr2:72770524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C35,C68
`Chr2:72770555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B137,B19,B5,C25,D9
`Chr2:72770555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B19,B5,C25,D9
`Chr2:72770558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B40,B69
`Chr2:72770573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B17,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793340.1

463 aa

232

463

F-box

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 30-64 aa PF08268 FBA_3 138-326 aa PF07734 FBA_1 139-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793340.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	30	64	9.8e-05	22.8	F-box domain
`XP_057793340.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	138	326	7.8e-10	39.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057793340.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	139	339	5.6e-11	42.7	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937357.1
ATGGATTCGGTAACTCTTCAGTTCCCAATACTATTGACAGCCGCCGCCGACGAGGAGGAGCCGCCAGAAACGGCTGCGGAGCTCAAAGACGACATTCTCGAAGAAATCCTGTCATGGTTGCCGGCGAAGTCGGTTTTCCGCTGGAAGAGCGTGAGCAAACCTTGGCAGCAGATGCTGGATAAGCCCCAATTCGCGAGAATCCATTTCTCTAGGGCTTCGGTTTGCCCTCTCCTCGTCTCCGGCGGGAAATCGGTCTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009961
ATGGATTCGGTAACTCTTCAGTTCCCAATACTATTGACAGCCGCCGCCGACGAGGAGGAGCCGCCAGAAACGGCTGCGGAGCTCAAAGACGACATTCTCGAAGAAATCCTGTCATGGTTGCCGGCGAAGTCGGTTTTCCGCTGGAAGAGCGTGAGCAAACCTTGGCAGCAGATGCTGGATAAGCCCCAATTCGCGAGAATCCATTTCTCTAGGGCTTCGGTTTGCCCTCTCCTCGTCTCCGGCGGGAAATCGGTCTGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793340.1
MDSVTLQFPILLTAAADEEEPPETAAELKDDILEEILSWLPAKSVFRWKSVSKPWQQMLDKPQFARIHFSRASVCPLLVSGGKSVCRSCRIMHLVEGRSVSDLDSGAFNSRLISRFDIRTRAAAEPSKVKDVFHGLNTNATSCEGLLCWTAYDQNRGDCIIVCNPITGEYVSLSSSPMDEDEIYAFVGMGYSRATKRFELLRMAARADDMEEDMVFWPEIRSVGGGDGSWRRVGGGTCQLVLCRTISQVVYVCGGVYWSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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