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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005139`

染色体: Chr02 坐标: 72817174-72821556 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005139`
名称	SmilChr02G005139
描述	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72817174 - 72821556 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009134`
GeneID	`131009134`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009134`
原始查询	`SmilChr02G005139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5
产物	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5
Arabidopsis	`AT1G06550` (AT1G06550) ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837166] identity=71.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0752200` (NOG1) - identity=65.4; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003860 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity); GO:0006574 (L-valine catabolic process)
KEGG	smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00640 (Propanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1); PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009134

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792337.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057792337.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792337.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792337.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792337.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72817389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:72817539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C79,C82
`Chr2:72817577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr2:72817586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:72817933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C26,C53,C55
`Chr2:72818301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:72818470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C79,C82
`Chr2:72818671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B69
`Chr2:72819037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B55,C47,D4
`Chr2:72819257`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A10,A9,B111,B13,B133,B137,B140,B26,B31,B4,B49,B5,B76,B87,B93,B97,B98,C12,C13,C20,C30,C36,C49,C67,C8,C82
`Chr2:72819403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792337.1

385 aa

192

385

ECH_1

ECH_2

PF00378 ECH_1 20-254 aa PF16113 ECH_2 21-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792337.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	20	254	8.1e-26	91.6	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057792337.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	21	353	3.7e-115	385.7	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936354.1
AAAAAGGAAGCATAAATTTGAAATAGAATATTGGTAGCGGTAGGTAGGCGAGGAAAATAGGAAGAAAGCATATGCTCACCAAACTGGCAAGCGGAGACTGGAAGCCCCACTTCCAAATTCCAACTACCTCACTCCTATATTCCCATATCATTGAACTTTATGATCACAACTACTCCTATTTTTGCTAAAGAAGAGTTCAGAGAGAGAGAGAGAGTGGCAGATTTTGCATTTTTCTGTGTTTCCTCTCTTATCTTGTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009134
ATGGCACAAGTGGTTGTCAATCCAGATGAAGAGGTTGTTCTAGGTGAGGAAGTAGGCCATGTAAGAGTGATTACCTTGAACCAGCCTCGACGATTGAATGTTATTTCATTTGAAGTGGTTGAGTTGCTGGCAAGGCTTCTGGAGAAATGGGAGAAAGATGACGAAGCAGAACTCATACTAATTAAGGGAACTGGCCGTGCATTCTCAGCTGGTGGGGATCTTAAAATGTTTTATGATGGAAGAATGTCAAAGGATCCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792337.1
MAQVVVNPDEEVVLGEEVGHVRVITLNQPRRLNVISFEVVELLARLLEKWEKDDEAELILIKGTGRAFSAGGDLKMFYDGRMSKDPSLEVVYRMYWLCYHIHTYKKTQVALVHGISMGGGASLMVPMKFSVVTEKSVFATPEASIGFHTDCGFSYMLSHLPGHLGEFLGLTGARLNGAELVTAGFATHLVPSEKLPELQNRLISLNSGDEHAVKSAIEEFSTNVEIDEQSILNKKPIIDECFAKDSVEEIIMSFEAEASK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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