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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005155`

染色体: Chr02 坐标: 72916532-72918911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005155`
名称	SmilChr02G005155
描述	60S ribosomal protein L11
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72916532 - 72918911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009146`
GeneID	`131009146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009146`
原始查询	`SmilChr02G005155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L11
产物	60S ribosomal protein L11
Arabidopsis	`AT2G42740` (RPL16A) ribosomal protein large subunit 16A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818874] identity=95.6; qcov=0.989; evalue=9.08e-129; confidence=high
Rice	`Os02g0235600` - identity=96; qcov=0.973; evalue=1.24e-126; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00281 (Ribosomal_L5); PF00673 (Ribosomal_L5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792353.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792353.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057792353.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792353.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792353.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72917577`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	68	A20,A21,A24,A4,A6,A7,A8,A9,B102,B107,B11,B114,B115,B119,B12,B124,B127,B128,B129,B132,B135,B137,B17,B19,B20,B27,B30,B31,B32,B35,B44,B5,B53,B56,B60,B68,B74,B76,B77,B82,B85,B86,B87,B90,B94,B96,B99,C11,C13,C14,C17,C21,C25,C31,C4,C49,C5,C50,C52,C58,C60,C64,C66,C69,C75,C80,C85,C86
`Chr2:72917605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C29,C40
`Chr2:72917618`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B115,B12,B77,B96
`Chr2:72917618`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B115,B12,B77,B96
`Chr2:72917656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,B98,D3
`Chr2:72918631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B55,C8
`Chr2:72918679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B88,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792353.1

182 aa

182

Ribosomal_L5

Ribosomal_L5_C

PF00281 Ribosomal_L5 9-62 aa PF00673 Ribosomal_L5_C 66-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792353.1`	Pfam	`PF00281`	Ribosomal_L5	Domain	9	62	1.4e-21	77.2	Ribosomal protein L5
`XP_057792353.1`	Pfam	`PF00673`	Ribosomal_L5_C	Domain	66	164	1.2e-18	67.7	ribosomal L5P family C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936370.1
ACGAAACACCCCCAACCCACTCATCAGTATTTAGTTAGGGTTTTTTTCTTCACCATTTCATAATCCCTAAAACCCTCTCAGTAGCTGCAGCGTCCGCGCCTCCCTACCTCAACGCCATGGCATCGGAGAAGAAACTCTCGAACCCAATGAGGGAAATCAAAGTTCAGAAGCTCGTCCTGAACATCTCTGTCGGTGAGAGCGGAGATCGTCTCACCAGAGCCGCCAAGGTTTTGGAACAGCTTAGCGGCCAAACCCCTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009146
ATGGCATCGGAGAAGAAACTCTCGAACCCAATGAGGGAAATCAAAGTTCAGAAGCTCGTCCTGAACATCTCTGTCGGTGAGAGCGGAGATCGTCTCACCAGAGCCGCCAAGGTTTTGGAACAGCTTAGCGGCCAAACCCCTGTTTTCTCCAAGGCAAGGTACACAGTGCGTTCGTTTGGGATCAGACGTAACGAGAAAATTGCATGCTATGTGACAGTGCGGGGTGATAAGGCAATGCAGCTCCTTGAGAGTGGACTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792353.1
MASEKKLSNPMREIKVQKLVLNISVGESGDRLTRAAKVLEQLSGQTPVFSKARYTVRSFGIRRNEKIACYVTVRGDKAMQLLESGLKVKEYELLRRNFSDTGCFGFGIQEHIDLGIKYDPSTGIYGMDFYVVLERPGYRVGRRRRCKARVGIQHRVTKEDSMKWFQVKYEGVILNKASNIGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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