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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005157`

染色体: Chr02 坐标: 72924622-72929389 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005157`
名称	SmilChr02G005157
描述	sec1 family domain-containing protein MIP3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72924622 - 72929389 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009147`
GeneID	`131009147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009147`
原始查询	`SmilChr02G005157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sec1 family domain-containing protein MIP3
产物	sec1 family domain-containing protein MIP3
Arabidopsis	`AT2G42700` (AT2G42700) vesicle docking protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818870] identity=59.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0169100` - identity=53.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF00995 (Sec1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792354.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057792354.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057792354.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057792354.1`
5	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057792354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72925117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B128,B69,C67
`Chr2:72925262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:72925531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B131,B140
`Chr2:72925570`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A20,A25,A4,B105,B113,B118,B126,B134,B135,B136,B138,B17,B23,B30,B37,B47,B5,B60,B64,B65,B69,B7,B75,B80,B81,B85,B86,C1,C11,C12,C13,C2,C20,C30,C35,C39,C4,C41,C50,C69,C7,C74,C75,C9,D3,D8,D9
`Chr2:72925571`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	47	A20,A25,A4,B105,B113,B118,B126,B134,B135,B136,B138,B17,B23,B30,B37,B47,B5,B60,B64,B65,B69,B7,B75,B80,B81,B85,B86,C1,C11,C12,C13,C2,C20,C30,C35,C39,C4,C41,C50,C69,C7,C74,C75,C9,D3,D8,D9
`Chr2:72925579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:72925586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C26
`Chr2:72925659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:72925815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B88,D6
`Chr2:72925830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:72926085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B127,B48,C18,C49
`Chr2:72926239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792354.1

863 aa

432

863

Sec1

PF00995 Sec1 209-852 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792354.1`	Pfam	`PF00995`	Sec1	Family	209	852	2.6e-13	50.7	Sec1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936371.1
AGGTATCATTTTTTAAAACACTTTGTTTTGTTTACGGAGTATAGTTTCTTTATCAATATGCAATATCTGGATCTGTTGGTCCTAACCTGGAGTCGGTCTTGTAGAAATTGAACCGCTTCTGATTATCTGCACTCCCCATTTTGTGGGTTTCTTCAGTCTTTAATCATAGAAGAAAAAGGAGCTGATCGATGGCCACGGTTGATGTGATCAAATGCTGTCATGATTCCATCCGACAAGCCTCGGAGAATATTAAAGATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009147
ATGGCCACGGTTGATGTGATCAAATGCTGTCATGATTCCATCCGACAAGCCTCGGAGAATATTAAAGATGCAATTGTGTATTTGGATGCTGGAAGTGCTGAGAGCTTCCAGTTTCTTGGCGCATTTCCCTTGCTTTTGGAGCTAGGGGCACGAGCTATTTGTAGCTTGGAGAGCATGTCGGTTGTTGATAAGGTTGTTGACTGGAACACCTGTTCTGATCCTGCCACTAAGATTGTGGTCATCACGTCGCGTCTTCTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792354.1
MATVDVIKCCHDSIRQASENIKDAIVYLDAGSAESFQFLGAFPLLLELGARAICSLESMSVVDKVVDWNTCSDPATKIVVITSRLLSDAHRYVLRCLSTLQNVGCCAVYTSISEVAHSAYPDSPLGPDAFREYESLLNQDYEELVKKHERPRTVPDDSGLKEGTASEAEGWSELTEIDDHSSIDYGISNAKLRGEDYFSGYPEDVGQKLVVSVHHFPLILCPLSPRVFVLPSEGSTAEASLSTEHESSISFGLPPLSTGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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