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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005158`

染色体: Chr02 坐标: 72935601-72936998 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005158`
名称	SmilChr02G005158
描述	phospholipase A1-IIdelta-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72935601 - 72936998 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009149`
GeneID	`131009149`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009149`
原始查询	`SmilChr02G005158`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1-IIdelta-like
产物	phospholipase A1-IIdelta-like
Arabidopsis	`AT2G42690` (AT2G42690) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818869] identity=46.2; qcov=1.04; evalue=2.12e-116; confidence=high
Rice	`Os01g0710700` - identity=44.9; qcov=1.06; evalue=1.59e-110; confidence=medium
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008970 (glycerophospholipid phospholipase A1 activity)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009149

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792356.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057792356.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792356.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792356.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72935643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:72935651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B67,B77,B91,D9
`Chr2:72935669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B76,C34,C70,C85
`Chr2:72935681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B124,B13,C14,C70
`Chr2:72935689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B109,B128,B129
`Chr2:72935715`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A6,B103,B2,B42,B43,B49,B70,B89,B99,C30,D5
`Chr2:72935748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B118,C11,C13,C87
`Chr2:72935813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B3,B95,C8
`Chr2:72935905`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	64	A1,A11,A13,A14,A15,A19,A7,A8,A9,B1,B108,B110,B112,B127,B129,B131,B20,B26,B32,B49,B56,B57,B59,B67,B70,B73,B74,B75,B76,B8,B82,B89,B9,B96,C10,C14,C16,C18,C20,C26,C29,C3,C30,C31,C32,C38,C40,C44,C46,C49,C53,C57,C58,C62,C68,C78,C83,C86,C87,D1,D10,D2,D5,D8
`Chr2:72935908`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A1,A11,A13,A14,A15,A19,A7,A8,A9,B1,B108,B110,B112,B127,B129,B20,B26,B32,B49,B56,B57,B59,B67,B70,B73,B74,B75,B76,B8,B82,B89,B9,B96,C10,C14,C16,C18,C20,C23,C26,C29,C3,C30,C31,C32,C38,C40,C44,C46,C49,C53,C57,C58,C62,C68,C78,C86,C87,D1,D10,D2,D5,D8
`Chr2:72935924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B110,C83
`Chr2:72936002`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A18,B19,B3,B35,B53,B55,B56,B57,B62,B95,B96,C5,C73,C8,C86,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792356.1

384 aa

192

384

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 122-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792356.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	122	273	9.9e-30	104.0	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936373.1
AAGTATATATACTAAGCCATGGAAAAAAGCATTAACGATGTTGCAGCGCCGTCATGGGCGGAGCTCCTCGGCAGCAACAACTGGGAAGGGCTACTTGACCCCTTAGACCTCTCCCTCCGCCGCTTCCTCCTCCACTGCGGCGACCTCGTCCAGTGCGTCGGCGACGCCTACATCAGGGATAACTCCCCCTACGTCGGCAACAGCCGCTACGGCGAGAAAACCTTCTTCCGCAAGGTCAAGTTCCCCTCCGCCTCCGCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009149
ATGGAAAAAAGCATTAACGATGTTGCAGCGCCGTCATGGGCGGAGCTCCTCGGCAGCAACAACTGGGAAGGGCTACTTGACCCCTTAGACCTCTCCCTCCGCCGCTTCCTCCTCCACTGCGGCGACCTCGTCCAGTGCGTCGGCGACGCCTACATCAGGGATAACTCCCCCTACGTCGGCAACAGCCGCTACGGCGAGAAAACCTTCTTCCGCAAGGTCAAGTTCCCCTCCGCCTCCGCTTACCAGATCTCCTCCTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792356.1
MEKSINDVAAPSWAELLGSNNWEGLLDPLDLSLRRFLLHCGDLVQCVGDAYIRDNSPYVGNSRYGEKTFFRKVKFPSASAYQISSFLYATSTLDIFPDSETNFIGYVATSTSTIPGRGRVIYVAWRGTESTLEWLNNAHIVPVPASAITPDAPGNVMDGWIRIYTSSNPNSQFGKLSAREQLRAQILQLRDQYKDENLSIVVAGHSLGAALAVLSAFDLVENVVPDIPVTAIVFACPRVGDGAFVERLGTHPSLKILHTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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