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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005160`

染色体: Chr02 坐标: 72946952-72949072 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005160`
名称	SmilChr02G005160
描述	phospholipase A1-IIdelta-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72946952 - 72949072 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009151`
GeneID	`131009151`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009151`
原始查询	`SmilChr02G005160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1-IIdelta-like
产物	phospholipase A1-IIdelta-like
Arabidopsis	`AT2G42690` (AT2G42690) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818869] identity=61.6; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0710700` - identity=51.4; qcov=1.02; evalue=1.33e-148; confidence=high
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0008970 (glycerophospholipid phospholipase A1 activity)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009151

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792358.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792358.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792358.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792358.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72947210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B68,B88
`Chr2:72947235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B95,C8
`Chr2:72947292`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B67,B78,B91,D9
`Chr2:72947292`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B67,B78,B91,D9
`Chr2:72947335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr2:72947363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:72947435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:72947456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:72947544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B58,B91,C55
`Chr2:72947617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr2:72947658`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr2:72947658`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792358.1

417 aa

208

417

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 141-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792358.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	141	306	1.2e-27	97.3	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936375.1
GTTCCAAAATTATATAAATTTAACCTTTACATCATTGTTATATCACACATACCACTCTCACTCTCAATCTCAGTCTCTCTCCCATAATTGCTAATTAACCTTTACACTAATTGGAATGAATGAATGGTTCACACAACACTCACACAAACCCTATCCTCTAATAATGAACATATCTTCTTCAATTCCTACTTGTCTCATATCTTTCTCAAATTCAAAAATTTCGATAAAAAAATTAATCATTCAATTCTAGCTAGCCATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009151
ATGGAAGAAACTCAGGCGTCAACAAACGCAGAAGCGGCGGTGCCGTGGCCGGAGCTTCTCGGCAGCAACGACTGGAGCGGCCTACTGGAGCCCCTAAACCTGGAGCTCCGCCGCCTCATCCTCCGCTGCGGCGACTTCTGCCAAGCCACCTACGACGCCTTCAACAACGACGCCAACTCCAAGTACGCCGGCAGCAGCCGCTACGGCAAGAAATCCTTCTTCGAGAAGGTCATGCTGGAGTCCGCCGCCGCCGACTACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792358.1
MEETQASTNAEAAVPWPELLGSNDWSGLLEPLNLELRRLILRCGDFCQATYDAFNNDANSKYAGSSRYGKKSFFEKVMLESAAADYQVSCFLYATAKVSVAEAVFLHSLSRQAWDRESNWIGYIAVTTDAATAALGRREIYVVWRGTSRNYEWINVLGATPQSAAQLLAGADAAAAGSSSSDEDGENVPKVMSGWMTIYVSSDPNSSFTKLSARSQLQTKIAQLRELYNEDRLSITLTGHSLGASLAILAAFDLVENGVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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