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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005164`

染色体: Chr02 坐标: 72976107-72978578 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005164`
名称	SmilChr02G005164
描述	F-box/LRR-repeat MAX2 homolog A
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	72976107 - 72978578 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009156`
GeneID	`131009156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009156`
原始查询	`SmilChr02G005164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat MAX2 homolog A
产物	F-box/LRR-repeat MAX2 homolog A
Arabidopsis	`AT2G42620` (MAX2) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818862] identity=58; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0154200` (D3) - identity=46.4; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF18511 (F-box_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792366.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792366.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792366.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792366.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:72976541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B45,B78,B82,C13
`Chr2:72976622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B119
`Chr2:72976703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:72976796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:72976812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:72976947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:72977144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B122,C73,D4
`Chr2:72977270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:72977509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:72977537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B119,B64,B76,D11
`Chr2:72977801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B36,B84,C81
`Chr2:72977885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B4,B9,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792366.1

713 aa

356

713

F-box_5

PF18511 F-box_5 13-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792366.1`	Pfam	`PF18511`	F-box_5	Domain	13	51	5.7e-08	32.9	F-box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936383.1
GAAACACTATTTTAATAATATTTGCTGAAAAGATCTAGGAAAGAAAAATATCGAAGAAAGAAGAAGATAAATACTACAAAAAGAAAGACTGAAGAAAATTAGCACTCACCAATCGAAAAAAATAAATAAAAATCAAGCCGATACCACCAGATTTGGATTTCCGCCGCCGCGCATGGCCTACGCCGCCGACGACGGGACCACCGTCAGCGACCTCCCTGACGTGATCCTCTCGAACATAATCGCCGCCGTGTCGGATGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009156
ATGGCCTACGCCGCCGACGACGGGACCACCGTCAGCGACCTCCCTGACGTGATCCTCTCGAACATAATCGCCGCCGTGTCGGATGTCCGCAGCCGCAACTCCGCCGCCTTGGTGTGCCGGAAGTGGTGCCTCCTGGAGCGCGCCAGCCGCGCCGCCCTGAGCCTCCGCGGCAACCTCCGCGACCTCTTCATGGTCCCCACCTGCTTCCCGTCCGTCTCCACCCTCGACCTCTCACTGCTCTCCCCCTGGGGCCACCCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792366.1
MAYAADDGTTVSDLPDVILSNIIAAVSDVRSRNSAALVCRKWCLLERASRAALSLRGNLRDLFMVPTCFPSVSTLDLSLLSPWGHPLSSASDPALIAHLLRHAFPSLSSLTFYARNLSTIQLVASQWQNVEHVKLVRWHQRPQVAAAGDELRMLFSECRRLKSLDLSSFYCWTDDVPPALESHPALASNLTRLDILNPSFSEGFKSDEIKVITKSCPNLREFKAVCRFDPRYIGFVGDDALVSISVNCKKLGILHLADTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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