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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005168`

染色体: Chr02 坐标: 73007525-73013228 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005168`
名称	SmilChr02G005168
描述	phosphoenolpyruvate carboxylase 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73007525 - 73013228 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009160`
GeneID	`131009160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009160`
原始查询	`SmilChr02G005168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoenolpyruvate carboxylase 2-like
产物	phosphoenolpyruvate carboxylase 2-like
Arabidopsis	`AT3G14940` (PPC3) phosphoenolpyruvate carboxylase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820723] identity=86.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0366000` (Osppc) - identity=85.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0008964 (phosphoenolpyruvate carboxylase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0015977 (carbon fixation); GO:0048046 (apoplast); GO:0048366 (leaf development)
KEGG	smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00311 (PEPcase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792370.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792370.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792370.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792370.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73009530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B59,C19,C36
`Chr2:73009653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,B98,D3
`Chr2:73010261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73010324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:73011043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,D10
`Chr2:73011059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:73011099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B40,B98,D3
`Chr2:73011235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A5,B70
`Chr2:73011315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B78,C54,C57,C74
`Chr2:73011359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C11,C69
`Chr2:73011401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D7
`Chr2:73011554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792370.1

966 aa

483

966

PEPcase

PF00311 PEPcase 33-966 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792370.1`	Pfam	`PF00311`	PEPcase	Family	33	966	0	1130.0	Phosphoenolpyruvate carboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936387.1
TGGAGGTTGAAAAAAAGTTGTGGGAAAGAACAAAAATTGATGATTTTACTGAACTGAGCTATCAAGAAAATTTTGTCTATAAAAGCAGAATCTCTCTACACCATTACTACCTCTGCTTGAAACCATCTCCTCTCCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCGTGATCTTTTTTTTTCTTCTGGTTTCTCAACTGCAATTCGATCATCCGTGACTTATCTAAGTTAAACCACTCGAAAATCCCGTGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009160
ATGAGTAGGAAGATAGAGAAAATGGCATCGATTGATGCACAATTGAGGCTGTTGGCGCCTGGGAAGGTTTCTGAGGATGATAAGCTGGTGGAGTATGATGCTCTGCTCTTGGACCGTTTTCTTGATATTCTTCAAGACTTGCATGGAGAGGAAATCAGAGAAACGGTTCAAGACTGTTATGAGATCTCCGCTGAGTATGAAGGCAATCGCGACCCTCAGAAACTGGAAGAGCTCGGACGAGTTCTCACCAGTTTGGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792370.1
MSRKIEKMASIDAQLRLLAPGKVSEDDKLVEYDALLLDRFLDILQDLHGEEIRETVQDCYEISAEYEGNRDPQKLEELGRVLTSLDAGDSIVIAKSFSHMLNLANLAEEVQIAYRRRIKLKKHDFSDEASATTESDIEETLKRLVGQLNKSPQEVFEALKNQTVDLVLTAHPTQSVRRSLLQKHARIRDCLTQLNAKDITPDDKQELDEALQREIQAAFRTDEIRRNPPTPQDEMRAGMSYFHETIWKGVPKFLRRVDTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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