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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005169`

染色体: Chr02 坐标: 73013770-73016778 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005169`
名称	SmilChr02G005169
描述	protein CONSERVED ONLY IN THE GREEN LINEAGE 160, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73013770 - 73016778 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009161`
GeneID	`131009161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009161`
原始查询	`SmilChr02G005169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CONSERVED ONLY IN THE GREEN LINEAGE 160, chloroplastic
产物	protein CONSERVED ONLY IN THE GREEN LINEAGE 160%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G31040` (AT2G31040) ATP synthase protein I-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817656] identity=66.1; qcov=1.02; evalue=5.94e-166; confidence=high
Rice	`Os01g0673800` (Os) - identity=58.9; qcov=0.967; evalue=4.52e-129; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24763 (CGL160_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057792371.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057792371.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057792371.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057792371.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73014071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:73014274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:73014284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:73015131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr2:73015140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B125,C11,C69
`Chr2:73015147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,C74
`Chr2:73015510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:73015511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr2:73015687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B78
`Chr2:73016480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,C14,C42,C60
`Chr2:73016618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792371.1

337 aa

168

337

CGL160_C

PF24763 CGL160_C 193-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792371.1`	Pfam	`PF24763`	CGL160_C	Domain	193	325	8.5e-72	240.5	CGL160, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936388.1
TTTATTTATGGAAAATGAGTCGAACACCAAAGCCATCTCGAAACCAAACAACACAATTGTTGAGATATTTGCTATCCCAACACACAGAGTGAGAATCAATGGCGGCAGTTCGTTGCTGCCTCTCAGTGACCTCCGCCGCCGTTCCCAGCTCCCAGGACTCCCCACCGTCACAAGCAGCGGCCACATCGAAGCCGCCGACCAAGATCATACTGCCGAACAAGAAGGCGGAGAAATGGTCGACTGGGGTGGCCCCTGGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009161
ATGGCGGCAGTTCGTTGCTGCCTCTCAGTGACCTCCGCCGCCGTTCCCAGCTCCCAGGACTCCCCACCGTCACAAGCAGCGGCCACATCGAAGCCGCCGACCAAGATCATACTGCCGAACAAGAAGGCGGAGAAATGGTCGACTGGGGTGGCCCCTGGGGAATACGGCGGCCCACCCACCACCACCAAGCTCCGGAAATACTGGGGCGGAGAGAAAGACCCTCTCGCCTCCGATGATTACTTGTGGAACAAAGATTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792371.1
MAAVRCCLSVTSAAVPSSQDSPPSQAAATSKPPTKIILPNKKAEKWSTGVAPGEYGGPPTTTKLRKYWGGEKDPLASDDYLWNKDFMDSMKKFIQDPDHVSPASAKEEPSGFLSLNRVMSLDNLEVDLSKELAAPSASLVEEQVEEEQTVSTAGRRWRPAPTRRELDKWDRAAKAATGGSDVMFRESRRPRGDPVVLAAQSREQYYKLKNKLQILTVGIGGIGLLSAYFTYSPEIAASYGAGLLGALAYMRMLGNSIDSM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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