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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005170`

染色体: Chr02 坐标: 73017312-73021128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005170`
名称	SmilChr02G005170
描述	14-3-3 protein 9
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73017312 - 73021128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009162`
GeneID	`131009162`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009162`
原始查询	`SmilChr02G005170`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	14-3-3 protein 9
产物	14-3-3 protein 9
Arabidopsis	`AT2G42590` (GRF9) ral regulatory factor 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818859] identity=77.1; qcov=1; evalue=2.79e-153; confidence=high
Rice	`Os02g0580300` (GF14E) - identity=72.8; qcov=0.969; evalue=1.53e-129; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00244 (14-3-3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009162

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792372.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792373.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057792372.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792372.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73018457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr2:73018778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:73019592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B119
`Chr2:73020821`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A11,A14,A15,A2,A23,A3,B102,B107,B13,B132,B135,B24,B47,B49,B50,B54,B56,B59,B73,B75,B79,B82,B87,B89,B96,C31,C32,C33,C42,C56,C65,C68,C81,D4
`Chr2:73020836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D7
`Chr2:73020843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792372.1

296 aa

148

296

14-3-3

PF00244 14-3-3 13-235 aa

XP_057792373.1

262 aa

131

262

14-3-3

PF00244 14-3-3 13-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792372.1`	Pfam	`PF00244`	14-3-3	Repeat	13	235	4.2e-108	360.8	14-3-3 protein
`XP_057792373.1`	Pfam	`PF00244`	14-3-3	Repeat	13	235	2.8e-108	361.4	14-3-3 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936390.1
GTAGGGGTTGACGTTTCCAAATTCCAAGTAGCGGACTTCAGTAGAAACCGTAGGGAACTGGAGGGAAATCACAGGAGAATAGCCGGTCAGACAATCAATCATTTTCTGAATATTTTTCAACTACTTTTCTCTCTCTCCACTCTACTCCTTTTTCCCCCCTTTGCTGCCGTGGAAATCGTTGGCGAGTCGGCAGCTGTCGAAAACCTAGAGAGAGAGAGAGATTGAGTCCCTTTGGATCGGCGATGGCTTCCTCTTCAGAT...

XM_057936389.1
CAAATTCCAAGTAGCGGACTTCAGTAGAAACCGTAGGGAACTGGAGGGAAATCACAGGAGAATAGCCGGTCAGACAATCAATCATTTTCTGAATATTTTTCAACTACTTTTCTCTCTCTCCACTCTACTCCTTTTTCCCCCCTTTGCTGCCGTGGAAATCGTTGGCGAGTCGGCAGCTGTCGAAAACCTAGAGAGAGAGAGAGATTGAGTCCCTTTGGATCGGCGATGGCTTCCTCTTCAGATCGCGAAACCGCTGTTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131009162
ATGGCTTCCTCTTCAGATCGCGAAACCGCTGTTTACACCGCTAAACTCGCCGAGCAAGCAGAGCGATACGATGAAATGGTGGAATCAATGAAAAAGGTCGCTAAAATGGATGTGGAGCTAACAATAGAAGAGAGGAACTTGCTATCTGTAGGGTACAAGAATGTGATTGGGTCTAGAAGAGCGTCGTGGAGAATCTTGTCATCAATTGAGCAAAAGGAAGAGTCAAGAGGAAATGAGCAGAATGCTAAGCGGATCAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057792372.1
MASSSDRETAVYTAKLAEQAERYDEMVESMKKVAKMDVELTIEERNLLSVGYKNVIGSRRASWRILSSIEQKEESRGNEQNAKRIKEYRQKVELELTNICNDIMTVIDEHLIPSCTAGESTVFYYKMKGDYYRYLAEFKAGNDRKDVADQSLKAYELATSSAETELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPERACHLAKQAFDEAISELDTLNEESYKDSTLILQLLRDNLTLWTSDIPEDADEGQKLDAATKVGGEGAV...

XP_057792373.1
MASSSDRETAVYTAKLAEQAERYDEMVESMKKVAKMDVELTIEERNLLSVGYKNVIGSRRASWRILSSIEQKEESRGNEQNAKRIKEYRQKVELELTNICNDIMTVIDEHLIPSCTAGESTVFYYKMKGDYYRYLAEFKAGNDRKDVADQSLKAYELATSSAETELPPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPERACHLAKQAFDEAISELDTLNEESYKDSTLILQLLRDNLTLWTSDIPEDADEGQKLDAATKVGGEGAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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