当前解析结果
SmilChr02G005191| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005191 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005191 |
| 描述 | cytochrome P450 76A1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73199416 - 73201412 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009184 |
|---|---|
| GeneID | 131009184 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009184 |
| 原始查询 | SmilChr02G005191 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 76A1-like |
| 产物 | cytochrome P450 76A1-like |
| Arabidopsis | AT3G52970 (CYP76G1)cytochrome P450, family 76, subfamily G, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824463] identity=40.4; qcov=1; evalue=5.51e-133; confidence=medium |
| Rice | Os03g0248200- identity=40.3; qcov=0.943; evalue=1.52e-123; confidence=medium |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009184 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057792417.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057792417.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792417.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792417.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792417.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73199695 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr2:73199733 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:73199748 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B83,C20,C59 |
Chr2:73199760 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr2:73199848 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,C32,C68,D6 |
Chr2:73199890 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr2:73199972 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B2,B98 |
Chr2:73199972 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B2,B98 |
Chr2:73200015 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B75 |
Chr2:73200015 |
CG |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr2:73200145 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B76 |
Chr2:73200188 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B81,C7 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057792417.1PF00067
p450 34-496 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057792417.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 34 | 496 | 1.4e-99 | 334.7 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。