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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005194`

染色体: Chr02 坐标: 73208114-73209167 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005194`
名称	SmilChr02G005194
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 9
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73208114 - 73209167 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009186`
GeneID	`131009186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009186`
原始查询	`SmilChr02G005194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 9
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 9
Arabidopsis	`AT1G03870` (FLA9) FASCICLIN-like arabinoogalactan 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839384] identity=57.5; qcov=0.873; evalue=6.13e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0668100` (OsFLA7) - identity=50.5; qcov=0.852; evalue=1.2e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057792419.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057792419.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057792419.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792419.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73208337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B85,B91,C72
`Chr2:73208358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C19,C41
`Chr2:73208362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73208374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B57,B62
`Chr2:73208386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B24,B76
`Chr2:73208405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:73208426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:73208443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B95,C39,C57
`Chr2:73208444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D5
`Chr2:73208455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:73208707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:73208827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792419.1

237 aa

118

237

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 45-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792419.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	45	177	5.5e-20	72.5	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936436.1
AAATTTCAATAATATATGTCTTTAAGACTTTATCATTCATATCTTGGATGAGCCAAGCAAGCCAGCTCATTCCAACAAAGTCCAACTTCCCCATCTCTTATCCCCCCCATACATAAAACCCATAAAAACCCCCACCACCACCCTCACTCACCCCCACCACCACCACCACAATGGCGCCGCGCTCCTTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTCGCCGCCTCCGCCTCCGCCCAGTCCGCCCCGGGCCCCGCCCCCGCGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009186
ATGGCGCCGCGCTCCTTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTCGCCGCCTCCGCCTCCGCCCAGTCCGCCCCGGGCCCCGCCCCCGCGGGCCCCATCAACGTGACCGCGATCCTCGAGAAGGCCGGGCAGTACACTCGGTTCATCCACTTCCTCAACATCACCCAGGCCGGCGACCAGCTCAACAACCAGGTCAACAACTCCCACGACGGCATGACGCTCTTCGCCCCGACCGACAACGCCTTCCAGAACCTCCCGCCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792419.1
MAPRSFLLLLPLLLAASASAQSAPGPAPAGPINVTAILEKAGQYTRFIHFLNITQAGDQLNNQVNNSHDGMTLFAPTDNAFQNLPPGALNDLTPQQQVQLVQNHICPKFYSLTDLLSVSNPVRTLTFGQPGGDFGLNFTGQNNQVNVSTGAVVAPVYNALRKDFPLAVYQVDKVLLPRFFDAAEAPSKAPAADGSKSGGGAADGATAPSTSNPAGSGAARVGVGMAIWLVCMGLVSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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