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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005208`

染色体: Chr02 坐标: 73318147-73322357 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005208`
名称	SmilChr02G005208
描述	homeobox-DDT domain protein RLT2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73318147 - 73322357 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009276`
GeneID	`131009276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009276`
原始查询	`SmilChr02G005208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-DDT domain protein RLT2-like
产物	homeobox-DDT domain protein RLT2-like
Arabidopsis	`AT5G44180` (RLT2) Homeodomain-like transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834441] identity=35.5; qcov=0.486; evalue=1.74e-13; confidence=low
Rice	`Os05g0562400` - identity=37.3; qcov=0.4; evalue=1.5e-13; confidence=low
GO	GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF31066 (DUF8799)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792544.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057792546.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792544.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792544.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792544.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73320798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B71,C28,C5,C8
`Chr2:73321078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A16,B50,B8
`Chr2:73321817`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr2:73321817`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr2:73321834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B40
`Chr2:73321999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C17,C79
`Chr2:73322029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B69
`Chr2:73322039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,C21,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792544.1

311 aa

156

311

DUF8799

PF31066 DUF8799 17-80 aa

XP_057792545.1

311 aa

156

311

DUF8799

PF31066 DUF8799 17-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792544.1`	Pfam	`PF31066`	DUF8799	Domain	17	80	1.3e-25	89.8	Domain of unknown function (DUF8799)
`XP_057792545.1`	Pfam	`PF31066`	DUF8799	Domain	17	80	1.3e-25	89.8	Domain of unknown function (DUF8799)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936561.1
CCTCTCGATTAATAAAGAAAAAGAAGCTAAGCTATCTTTGGTTTTCTCCCTCTCAAGTCAATATGGTCTTGAACTAACTCGGAAAGGATGAAATTTGAATATCCATCTTTTGCTTTGCTTTGCTTTGGTATTTAATTTGAGGTTCTATGGGAAAACATGCATTTACTTACGCCAAATTGCAGGGATGCTCGGCCAGCCGTGACCTAACTTCAACCAGCTCTGGCAAACGTGGGTCTAGGATGGAAGCTTGACAAGCTTAT...

XM_057936563.1
CCTCTCGATTAATAAAGAAAAAGAAGCTAAGCTATCTTTGGTTTTCTCCCTCTCAAGTCAATATGGTCTTGAACTAACTCGGAAAGGATGAAATTTGAATATCCATCTTTTGCTTTGCTTTGCTTTGGTATTTAATTTGAGGTTCTATGGGAAAACATGCATTTACTTACGCCAAATTGCAGGGATGCTCGGCCAGCCGTGACCTAACTTCAACCAGCTCTGGCAAACGTGGGTCTAGGATGGAAGCTTGACAAGCTTAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131009276
ATGAACCAGAGTGAAGAGTTTGACGACATCGTACTTGACATCTCTCTTCCCCCGAGAATCGTTTTGCTGAAAGTTCAATTAGCTACAATTGAGGCATCTATTCCCTCAGATGCTCTCGAATCCTTCTGGTCAGACGAATACAGAAAATCTTGGGGCAGGAAGTTGCATATGTCATTGACGGCTAAAGAGCTTCTTCAGTGCTTGACGTTGCTGGAAGATAGCATCAAGAGGGAATTTTTGTCGGTGAATTACGAGACCTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057792544.1
MNQSEEFDDIVLDISLPPRIVLLKVQLATIEASIPSDALESFWSDEYRKSWGRKLHMSLTAKELLQCLTLLEDSIKREFLSVNYETSSEILSSSKVVGCSSRPGVVPIPPWMPLTAPAVALRLMDLDASIYYTYEHEETCQKNGEDGYFNNFSSLYSAFGCSVDNPSQAGSSRLDNCWVDLRNGRSVLKRGRGRPKGPSRTRGGKFQGRAANALYADGFSGAGSRNFTESVDYGKGDEHGEDVDYDDDEYNDEEDDDGVD...

XP_057792545.1
MNQSEEFDDIVLDISLPPRIVLLKVQLATIEASIPSDALESFWSDEYRKSWGRKLHMSLTAKELLQCLTLLEDSIKREFLSVNYETSSEILSSSKVVGCSSRPGVVPIPPWMPLTAPAVALRLMDLDASIYYTYEHEETCQKNGEDGYFNNFSSLYSAFGCSVDNPSQAGSSRLDNCWVDLRNGRSVLKRGRGRPKGPSRTRGGKFQGRAANALYADGFSGAGSRNFTESVDYGKGDEHGEDVDYDDDEYNDEEDDDGVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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