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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005216`

染色体: Chr02 坐标: 73355685-73358919 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005216`
名称	SmilChr02G005216
描述	homeobox-DDT domain protein RLT2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73355685 - 73358919 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009278`
GeneID	`131009278`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009278`
原始查询	`SmilChr02G005216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-DDT domain protein RLT2-like
产物	homeobox-DDT domain protein RLT2-like
Arabidopsis	`AT5G44180` (RLT2) Homeodomain-like transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834441] identity=35.2; qcov=0.508; evalue=2.24e-13; confidence=low
Rice	`Os05g0562400` - identity=37.3; qcov=0.405; evalue=1.43e-13; confidence=low
GO	GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF31066 (DUF8799)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792549.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057792551.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792549.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792549.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73357384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,C1,C22,C68
`Chr2:73357583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr2:73357664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C33,C61
`Chr2:73358635`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C72
`Chr2:73358635`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792549.1

308 aa

154

308

DUF8799

PF31066 DUF8799 17-80 aa

XP_057792550.1

308 aa

154

308

DUF8799

PF31066 DUF8799 17-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792549.1`	Pfam	`PF31066`	DUF8799	Domain	17	80	1.3e-25	89.8	Domain of unknown function (DUF8799)
`XP_057792550.1`	Pfam	`PF31066`	DUF8799	Domain	17	80	1.3e-25	89.8	Domain of unknown function (DUF8799)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936566.1
TTAAAGGGACGCACCCACTGATGAAACTCCTGTGTTTAAATTATTATGCTTCCCTTTAAGGATCATGGATTATGGCAAACTACTCAACCTTCGTCATACTATATTCCTTTATCTGCGTCGCTATAAGTGAATCAATATTTTTGGAAAATTCGAGCTGAATCGAGATTTTTGATGAATATGTGACTGGTATTTCTCTGCTCTGACGGGTATTTCTCTGCTCTGACGGGCATTTCTCTACTCTGACCGAGTTGATTTGAAGG...

XM_057936568.1
TTAAAGGGACGCACCCACTGATGAAACTCCTGTGTTTAAATTATTATGCTTCCCTTTAAGGATCATGGATTATGGCAAACTACTCAACCTTCGTCATACTATATTCCTTTATCTGCGTCGCTATAAGTGAATCAATATTTTTGGAAAATTCGAGCTGAATCGAGATTTTTGATGAATATGTGACTGGTATTTCTCTGCTCTGACGGGTATTTCTCTGCTCTGACGGGCATTTCTCTACTCTGACCGAGTTGATTTGAAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131009278
ATGAACCAGAGTGAAGAGTTTGACGACATCGTACTTGACATCTCTCTTCCCCCGAGAATCGTTTTGCTGAAAGTTCAATTAGCTACAATTGAGGCATCTATTCCCTCAGATGCTCTCGAATCCTTCTGGTCAGACGAATACAGAAAATCTTGGGGCAGGAAGTTGCATATGTCATTGACGGCTAAAGAGCTTCTTCAGTGCTTGACGTTGCTGGAAGATAGCATCAAGAGGGAATTTTTGTCGGTGAATTACGAGACCTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057792549.1
MNQSEEFDDIVLDISLPPRIVLLKVQLATIEASIPSDALESFWSDEYRKSWGRKLHMSLTAKELLQCLTLLEDSIKREFLSVNYETSSEILSSSKVVGCSSRPGVVPIPPWMPLTAPAVALRLMDLDASIYYTYEHEETCEKNGEDGYFNNFSSLYSAFGCSVDNPSQAGSSRLDNCWVDLRNGRSVLKRGRGRPKGPSRTRGGKFQGRAANALYADGFSGAGSRNFTESVDYGKGDEHGEDVDYDDDEYNDEEDDDGVD...

XP_057792550.1
MNQSEEFDDIVLDISLPPRIVLLKVQLATIEASIPSDALESFWSDEYRKSWGRKLHMSLTAKELLQCLTLLEDSIKREFLSVNYETSSEILSSSKVVGCSSRPGVVPIPPWMPLTAPAVALRLMDLDASIYYTYEHEETCEKNGEDGYFNNFSSLYSAFGCSVDNPSQAGSSRLDNCWVDLRNGRSVLKRGRGRPKGPSRTRGGKFQGRAANALYADGFSGAGSRNFTESVDYGKGDEHGEDVDYDDDEYNDEEDDDGVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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