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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005221`

染色体: Chr02 坐标: 73426913-73431663 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005221`
名称	SmilChr02G005221
描述	uncharacterized SmilChr02G005221
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73426913 - 73431663 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009203`
GeneID	`131009203`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009203`
原始查询	`SmilChr02G005221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Serine/threonine-protein kinase Rio1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833709]; symbol=AT5G37350; hit=AT5G37350; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Serine/threonine-protein kinase Rio1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833709]; symbol=AT5G37350; hit=AT5G37350; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G37350` (AT5G37350) Serine/threonine-protein kinase Rio1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833709] identity=78.2; qcov=0.716; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0162300` - identity=67; qcov=0.815; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01163 (RIO1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009203

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792440.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792440.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057792440.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057792440.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057792440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73427416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:73427463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B40,B75,C1
`Chr2:73427557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B16,B6,C86
`Chr2:73428890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B53,B6,D1
`Chr2:73428896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,C20,C38,C64,C66
`Chr2:73429091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:73429396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73430183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,C20,C38,C64,C66
`Chr2:73430221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B122,C7,C79
`Chr2:73430333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B4
`Chr2:73430575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:73431093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792440.1

595 aa

298

595

RIO1

PF01163 RIO1 215-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792440.1`	Pfam	`PF01163`	RIO1	Domain	215	402	3.7e-75	252.4	RIO domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936457.1
CACTCACTTTTTCTCTCTCAAATCTCCCTAATTTAGCCCCACGACCAGACAAAATTCGCCGACTCACGGACGCAAGGTCCGCCGCCTCTCCTTCTCCGGCGACGAACGCCGCCGGTCACTCTACCCCTCCGACTCAAAGACCCCGCCCAGACAAACATCTCGCGCCGCCTCCCTCTCAAAATCGGCGGCCGCAGCAGCCGACAAGGCCTACCGCCGCCGCCTGACGTCCCTCGAAACAGACCAGCGAACAGCAGCAGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009203
ATGGCTCCTTGCAGCCAGCGTCGCCGCCCGGACTTTACCCGACTCGACTCACACACACACCGAAGTAACAACCCCGACGCAGCCAGTTCAAAACAAGAAATAAAAATCGAAGCTTCAAAGAAAAAAGAGGGAGAAGAAATTACCAAAGAAGAGAGAGAAGAGGACTGGGAGGGAGAGGAAGACGATGACGACGAGTATTATCTGTCATCGGAGTCGGAAATAGCGGAGGCGTTGGACTTTTTGGACTCGAGAGAAGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792440.1
MAPCSQRRRPDFTRLDSHTHRSNNPDAASSKQEIKIEASKKKEGEEITKEEREEDWEGEEDDDDEYYLSSESEIAEALDFLDSREDAEGGILDGSFTPLHTRRPNAHGGLHSRPNNSSLQPISNKSQKVANHIRASPLEEWEGRFDVGMSNSVTTAIRGSVRDMAIGKTKTTEKADRATVEQAIDPRTRMVLFKMLNRGIFNDINGCISTGKEANVYHATKSDGQELAIKVYKTSVLVFKDRDRYVQGDYRFRHGYCKHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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