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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005222`

染色体: Chr02 坐标: 73432697-73435402 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005222`
名称	SmilChr02G005222
描述	nicotianamine aminotransferase A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73432697 - 73435402 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009972`
GeneID	`131009972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009972`
原始查询	`SmilChr02G005222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nicotianamine aminotransferase A-like
产物	nicotianamine aminotransferase A-like
Arabidopsis	`AT5G53970` (TAT7) Tyrosine transaminase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835480] identity=47; qcov=1.06; evalue=3.2e-67; confidence=high
Rice	`Os02g0302700` (OsNAAT2) - identity=44.5; qcov=1.06; evalue=3.16e-68; confidence=medium
GO	GO:0003824 (catalytic activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057793351.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057793351.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057793351.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793351.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73432720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B131,C35
`Chr2:73432753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B95
`Chr2:73432754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B95
`Chr2:73432766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr2:73433791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:73433792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C78
`Chr2:73433820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B129,C53,C54
`Chr2:73433832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,A4,C87
`Chr2:73435267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:73435338`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr2:73435338`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793351.1

190 aa

190

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 2-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793351.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	2	187	1.3e-19	71.4	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937368.1
ATGGAGATCCGCGAATTCGATCTCCTTCCCCACAAAGATTGGGAGGTCGACCTCGACGGTGTCGAAGCTGTGGCCGATGATGAGACTATTGCTATGGTGGTCATCAACCCTGGATACCCTACTGGAAATCTTTTCACTTTGGACCATATGCAAAAGGTACGAAACGCGATACAGGGACACATTGTTTTTGGAAGTCAAGAATTCATACCAATGGGGATTTTTGGATCTCTAACTCCTGTCCTTACCGTTGGATCACTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009972
ATGGAGATCCGCGAATTCGATCTCCTTCCCCACAAAGATTGGGAGGTCGACCTCGACGGTGTCGAAGCTGTGGCCGATGATGAGACTATTGCTATGGTGGTCATCAACCCTGGATACCCTACTGGAAATCTTTTCACTTTGGACCATATGCAAAAGGTACGAAACGCGATACAGGGACACATTGTTTTTGGAAGTCAAGAATTCATACCAATGGGGATTTTTGGATCTCTAACTCCTGTCCTTACCGTTGGATCACTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793351.1
MEIREFDLLPHKDWEVDLDGVEAVADDETIAMVVINPGYPTGNLFTLDHMQKVRNAIQGHIVFGSQEFIPMGIFGSLTPVLTVGSLSKRWLIPGWRLGWIAVSDPNRLLNKSGIIESIQKYLCMTSSPATLIQGAVAEILERTPTDFFEKTVKTIRESAEKCYKLINEIPCISCPTKPQGCMFLMVIINI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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