当前解析结果
SmilChr02G005225| 统一新 Gene ID | SmilChr02G005225 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G005225 |
| 描述 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 73462854 - 73465845 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009329 |
|---|---|
| GeneID | 131009329 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009329 |
| 原始查询 | SmilChr02G005225 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial-like |
| 产物 | protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT2G33847 (AT2G33847)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007926] identity=60.5; qcov=0.88; evalue=1.56e-21; confidence=medium |
| Rice | Os01g0238800- identity=65.9; qcov=0.478; evalue=7.37e-14; confidence=low |
| GO | GO:0005739 (mitochondrion) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009329 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057792611.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057792611.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.20000 | XP_057792611.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057792611.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792611.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:73463298 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B119,B8 |
Chr2:73463468 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B1,B11,B123,C87 |
Chr2:73463475 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr2:73465011 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C53 |
Chr2:73465011 |
ATG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
7 records
下载 cDNA FASTA7 records
下载 CDS FASTA7 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。