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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005232`

染色体: Chr02 坐标: 73515055-73516164 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005232`
名称	SmilChr02G005232
描述	ethylene-responsive transcription factor 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73515055 - 73516164 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009303`
GeneID	`131009303`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009303`
原始查询	`SmilChr02G005232`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor 4-like
产物	ethylene-responsive transcription factor 4-like
Arabidopsis	`AT5G44210` (ERF9) erf domain protein 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834444] identity=43.4; qcov=1.02; evalue=4.36e-39; confidence=medium
Rice	`Os05g0497300` (OsERF#074) - identity=48.1; qcov=0.995; evalue=3.21e-27; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009303

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792584.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792584.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792584.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792584.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792584.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73515329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:73515348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,C11,C69,D7
`Chr2:73515489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C28
`Chr2:73515497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:73515546`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A5,B115,B117,B125,B14,B25,B52,B78,B88,C11,C20,C27,C6,C61,C69
`Chr2:73515552`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr2:73515552`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr2:73515569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:73515693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:73515800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B7,C85
`Chr2:73515909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B68,B80,D5
`Chr2:73515945`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A16,A8,B121,B36,B86,C36,C46,C52,C80,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792584.1

217 aa

108

217

AP2

PF00847 AP2 23-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792584.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	23	72	8.5e-16	58.7	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936601.1
TACAGTATATACATACATACTCTCTCAATTACTTGGGCGGCGGCCCCCATTCCGCCCCCAGTCAAATCCCTCGTTGACCGCGCCACCCCCTACCCCCCAACCCAAACATTTTCCCTATATAAAAAGGAGCTTCCGCAAACCATATCCATAGCCCATCTCAACACCAGCTTTCTCTCACTAGAAAAAATTTAACAGAATTATTGTGCGGAACGGTTTGCGACGGAGAGGTAGGGAGATCGAGAATGGCGATGAAGGAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009303
ATGGCGATGAAGGAGAAGGCGGCCGGCGGCGGCGGAAACGGAAAGGCGGGCGGCGTCAAGGAGGTGCACTACAGGGGGGTGAGGAAGAGGCCGTGGGGGCGGTACGCCGCCGAAATCCGCGATCCGGGGAAGAAATCTCGCGTCTGGCTCGGGACCTTCGACACCGCCGAGGAGGCGGCGCGTGCCTACGACGCCGCGGCGAGGGAATTCCGCGGCGCTAAGGCGAAGACGAACTTCTCGGACGGCGGCGGCGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792584.1
MAMKEKAAGGGGNGKAGGVKEVHYRGVRKRPWGRYAAEIRDPGKKSRVWLGTFDTAEEAARAYDAAAREFRGAKAKTNFSDGGGAAAAIHSPSQSSTVESSSADLNARAPVVELDLTRRLGAVPDRGVTVAEAGPIGGYQFFRRQPTMAVLPNGQPVILFDPAMAAAYRLNAAAYGRGGAVQSDSDTSSVVDENNFDGAEAKRGLDLDLNMPPPVEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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