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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005233`

染色体: Chr02 坐标: 73532384-73533959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005233`
名称	SmilChr02G005233
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73532384 - 73533959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009254`
GeneID	`131009254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009254`
原始查询	`SmilChr02G005233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 2-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT1G03790` (SOM) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839408] identity=40.1; qcov=1.01; evalue=1.76e-79; confidence=medium
Rice	`Os01g0192000` (DOS) - identity=61.4; qcov=0.386; evalue=1.62e-61; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF25512 (zf-CCCH_AtC3H23)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792514.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792514.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057792514.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057792514.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792514.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73532891`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C77
`Chr2:73532891`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C77
`Chr2:73532895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:73532899`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	103	A16,A2,A21,A23,A4,A5,A7,B10,B104,B109,B112,B113,B114,B119,B120,B122,B123,B129,B132,B135,B137,B140,B15,B2,B20,B24,B25,B3,B30,B33,B38,B39,B4,B43,B44,B46,B5,B58,B60,B66,B67,B71,B73,B75,B77,B79,B80,B84,B85,B89,B90,B92,B94,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C33,C35,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C48,C50,C55,C56,C6,C61,C67,C69,C70,C71,C72,C75,C76,C78,C8,C80,C82,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D7,D8,D9
`Chr2:73532902`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	104	A16,A2,A21,A23,A4,A5,A7,B10,B104,B109,B112,B113,B114,B119,B120,B122,B123,B129,B132,B135,B137,B140,B15,B2,B20,B24,B25,B3,B30,B33,B38,B39,B4,B43,B44,B46,B5,B58,B60,B66,B67,B71,B73,B75,B77,B79,B80,B84,B85,B89,B90,B92,B94,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C33,C35,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C48,C50,C55,C56,C6,C61,C67,C69,C70,C71,C72,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C82,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D7,D8,D9
`Chr2:73532932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B98,C18,C29,C36
`Chr2:73532936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B26,B34,B36
`Chr2:73532975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C55
`Chr2:73533041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B26,B34,B36
`Chr2:73533046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:73533205`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C34
`Chr2:73533205`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792514.1

396 aa

198

396

zf-CCCH_AtC3H23

PF25512 zf-CCCH_AtC3H23 142-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792514.1`	Pfam	`PF25512`	zf-CCCH_AtC3H23	Domain	142	175	1.3e-21	76.7	AtC3H23-like, CCCH zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936531.1
TGTAATAGTGTGATATCGAGGTGCCACATATCTCCCTCTGCATGCAAACATCCCTAATACTATGCCGCCACGCACCTCTCTGCCCATACTCTCACACCATCCTCGTCACCTCTCTCTCTCTCATCACTATATACCTATAAAAATCACAACCCCCTCTCCCTCTCTCTCTCATCTAACTCCAAATTTAATTCAAAATTCTAATAATCACCCCAAAATTATGATGGGCAGCGTTTGCGCCGAGCAGCAACACAAGTTCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009254
ATGCCGCCACGCACCTCTCTGCCCATACTCTCACACCATCCTCGTCACCTCTCTCTCTCTCATCACTATATACCTATAAAAATCACAACCCCCTCTCCCTCTCTCTCTCATCTAACTCCAAATTTAATTCAAAATTCTAATAATCACCCCAAAATTATGATGGGCAGCGTTTGCGCCGAGCAGCAACACAAGTTCCACCACTCCCACCAACTCCTCCTCACCAAGAAGGCCCTCCGCGACATCGACATACCCCCCCGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792514.1
MPPRTSLPILSHHPRHLSLSHHYIPIKITTPSPSLSHLTPNLIQNSNNHPKIMMGSVCAEQQHKFHHSHQLLLTKKALRDIDIPPRKQLLLSRSSPRSGSGGGASDAAELHSSAASFSKFLPYNDGDEGGDEDGDDPYSSDHFRMYEFKVRKCNRSRSHDWTDCPFAHPGEKARRRDPRRHHYSGSVCPDFRKGHCGKGDACELSHGVFECWLHPSRYRTEACKDGRSCKRKVCFFAHSSRQLRIVPDPTPAPASPTADH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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