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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005239`

染色体: Chr02 坐标: 73567840-73571789 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005239`
名称	SmilChr02G005239
描述	mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73567840 - 73571789 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009213`
GeneID	`131009213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009213`
原始查询	`SmilChr02G005239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
产物	mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1
Arabidopsis	`AT2G20635` (AT2G20635) protein kinase and Mad3-BUB1-I domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816591] identity=58.1; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0508500` (BRK1) - identity=51.5; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007094 (mitotic spindle assembly checkpoint signaling); GO:0051754 (meiotic sister chromatid cohesion, centromeric)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF08311 (Mad3_BUB1_I)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792451.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057792451.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792451.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057792451.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057792451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73567982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B67,B74
`Chr2:73568161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C61
`Chr2:73568251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr2:73568639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C47,C8
`Chr2:73568899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C78,D11
`Chr2:73568939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr2:73569790`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C68
`Chr2:73569790`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C68
`Chr2:73569966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr2:73569973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C75
`Chr2:73570099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr2:73570136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792451.1

536 aa

268

536

Mad3_BUB1_I

Pkinase

PF08311 Mad3_BUB1_I 14-129 aa PF00069 Pkinase 232-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792451.1`	Pfam	`PF08311`	Mad3_BUB1_I	Repeat	14	129	3.4e-21	76.2	Mad3/BUB1 homology region 1
`XP_057792451.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	232	450	6.7e-12	46.1	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936468.1
GCTTTCAGATTTCAAATATTCAAGCTTACAGTGTTTCCTGCTTCACGTCGGAGTAAGAATCTGCGATTTCATGGCCGTCGTTTCGAGAAATTCCGGCAACATCAGCGACGTCTCCTCCTCTGTTACCGACGATCCTATCTTACCTTCGCTCCAGTTAATTTATGAGGCATTGCGAAGGCAAAATTCGAGCGATCAAATCAATTTTGCGGATTTCGATGTGCTCGTTGCGAATTGTATTAATAACTTCAAGTCCGATCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009213
ATGGCCGTCGTTTCGAGAAATTCCGGCAACATCAGCGACGTCTCCTCCTCTGTTACCGACGATCCTATCTTACCTTCGCTCCAGTTAATTTATGAGGCATTGCGAAGGCAAAATTCGAGCGATCAAATCAATTTTGCGGATTTCGATGTGCTCGTTGCGAATTGTATTAATAACTTCAAGTCCGATCCGCGGTATCGAGACGACATCCGATTTCTCAAGATCTGGTTCCTCTATATGGATGGTAGCTCAGATTATGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792451.1
MAVVSRNSGNISDVSSSVTDDPILPSLQLIYEALRRQNSSDQINFADFDVLVANCINNFKSDPRYRDDIRFLKIWFLYMDGSSDYERVFKEIEEHRICIRKALLYESFALFLEAKGRLIDACMIYHLGISRNAEPLGRLKKAQVLFLERMSERVTNGSFQKMKNDVSVDGENFINPWSVSTLKNLLQKMNSKVVEYEGYHSSNKAYPGKVALSSLQKSAKNKDITIGRENYQIRGRAGQGGFAQVFKAYVDGKPDDVVAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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