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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005243`

染色体: Chr02 坐标: 73599124-73600646 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005243`
名称	SmilChr02G005243
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73599124 - 73600646 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009307`
GeneID	`131009307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009307`
原始查询	`SmilChr02G005243`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
Arabidopsis	`AT4G14540` (NF-YB3) nuclear factor Y, subunit B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827101] identity=90; qcov=0.609; evalue=6.42e-78; confidence=high
Rice	`Os07g0606600` (OsHAP3F) - identity=84.6; qcov=0.594; evalue=4.85e-71; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016602 (CCAAT-binding factor complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792588.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792588.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792588.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792588.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73599488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:73599521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C62,C73
`Chr2:73599584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr2:73599641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C8
`Chr2:73599668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr2:73599785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C58,C8
`Chr2:73599857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C58,C8
`Chr2:73599862`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A19,A7,B10,B11,B120,B121,B131,B132,B137,B20,B26,B31,B32,B33,B37,B45,B53,B54,B55,B64,B68,B76,B78,B8,C37,C45,C48,C72,C8,C87,D3,D4,D9
`Chr2:73599870`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A19,A7,B10,B11,B120,B121,B131,B132,B137,B20,B26,B31,B32,B33,B37,B45,B53,B54,B55,B64,B68,B76,B78,B8,C37,C45,C48,C72,C8,C87,D3,D4,D9
`Chr2:73599932`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C48,C8,D3
`Chr2:73599932`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C48,C8,D3
`Chr2:73599938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,B28,B64,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792588.1

197 aa

197

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 24-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792588.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	24	88	1.2e-27	96.6	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936605.1
GAAGGGTATAAATTTAACTTTCCGATTTTACAGACAGGAATAAGAATCTTAAAAACAACAACAATCGATCTCAAAAAAAAAGTGAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAGTTAAAACTTTAGGCGTTGTGTTGTGTAGCGGTGCATTCAAGAATTTCATGACCCAAATCGGCCAATCAAACCTACCCACCACGTTCCTCCTCTCCCAGCCGTCTGATCTCCTCATCATCAACGGCTCCCCTCTCTCCACGTGGTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009307
ATGGCGGATTCCGACAACGATTCCGGCGGGCACAGCAACAGCAACGCGAGCAGCAGGGAGCAGGACAGGTTCCTGCCGATCGCGAACGTGAGCAGGATCATGAAGAAGGCCTTGCCGGCGAACGCGAAGATATCGAAGGACGCGAAGGAGACGGTGCAGGAGTGCGTGTCGGAGTTCATCAGCTTCGTGACCGGCGAGGCCTCCGACAAGTGCCAGAGGGAGAAGCGGAAGACGATCAACGGCGACGATTTGCTGTGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792588.1
MADSDNDSGGHSNSNASSREQDRFLPIANVSRIMKKALPANAKISKDAKETVQECVSEFISFVTGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAMTTLGFEEYVEPLKVYLAKYREMEGEKSSIAGVKEGGGGGGGGGAVSSGAGFNGGGIYGGNVMGFHPGGQMYGGGGAGGGGFQHMGKGGLGNMGGGGGYGGGGASTGRPR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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