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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G005247`

染色体: Chr02 坐标: 73616793-73625585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G005247`
名称	SmilChr02G005247
描述	transmembrane E3 ubiquitin-protein ligase FLY2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	73616793 - 73625585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009211`
GeneID	`131009211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009211`
原始查询	`SmilChr02G005247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane E3 ubiquitin-protein ligase FLY2-like
产物	transmembrane E3 ubiquitin-protein ligase FLY2-like
Arabidopsis	`AT2G20650` (AT2G20650) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816593] identity=75.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0501900` - identity=73; qcov=0.8; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF11145 (DUF2921); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057792449.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057792449.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057792449.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792449.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:73621217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:73621528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr2:73621575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73622432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:73623151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:73623179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:73623335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:73623466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D1
`Chr2:73623644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:73623670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D1
`Chr2:73623685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D1
`Chr2:73623806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792449.1

560 aa

280

560

DUF2921

zf-RING_11

zf-RING_2

PF11145 DUF2921 254-488 aa PF17123 zf-RING_11 509-540 aa PF13639 zf-RING_2 509-554 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792449.1`	Pfam	`PF11145`	DUF2921	Repeat	254	488	2.9e-99	332.2	Transmembrane E3 ligase/DUF2921 transmembrane domain
`XP_057792449.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	509	540	2.6e-06	27.7	RING-like zinc finger
`XP_057792449.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	509	554	2.7e-11	44.3	Ring finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936466.1
AGTATCAAACCCACCTGAGCAAAATAGTCTTCCATTTATCGTCTTGACTTCAGTTTTACCCAACAACAAGTACAAACAGCCCTGAAACAATTTCACAAATTCAGAAAAAAGGGATTGCAAATAGCACTCAGTTGAATTAATTAATGATTAGATTATGTTCGTTTCTGGTTCCAAAATTGACTGGTGGAGGTCAAGCATGATTTCCGTTTGCAACCCAAATACAAATTGATCATTTCCTTTCCTCTTTTTTCTTTTTTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009211
ATGGGTTGGATGGGGAGTTGGAATGTTTTGGGCTTTTTGTTTCGAATTCTTTTTGGGTGGTCCATTTTAATGGTGATGTGGCCTGTGAATGGTTTGAGACCTTTGAGGCAGAGACGGTCTTGGGGTGAAGAGTGGCTTCCTATAGGTAAGGAAGAGCAAGAATTGGGACCGTTTTCTTCTTGGAATATAACAGGGACCTATAGAGGGAATTGGAAGTTTCCAGATTCTGCAAATAGCTCTTCCAAGTTTTCTGATTTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792449.1
MGWMGSWNVLGFLFRILFGWSILMVMWPVNGLRPLRQRRSWGEEWLPIGKEEQELGPFSSWNITGTYRGNWKFPDSANSSSKFSDFRKSNGNSILELISTPTKITGVHYVQGIIIFHDVFDNENDVHGAQIRVEGVYIWPFRQLRMVANSGKESEFGQEDDYLLSNPYHLLGVFSSQVFQESPREKIWKRKHSPIYEMEKHCNIEISAQISRVSSRKNGGDQDKYYLEGLMESPSVDDDVDCFSPMLLNATSVNVEVYYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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